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楼主 Author: qingxin
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[Gaussian/gview] 关于TDDFT优化三重态激发态T1/T2,激发能为负值如何消除

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发表于 Post on 2024-4-20 19:20:55 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-20 19:19
对,这个体系的光解量子产率估计主要取决于C-Br解离以后,有多少Br原子逃不出溶剂笼,又回来和碳原子复合 ...

老师,这个反应是气相光解,实验测定值也是气相量子产率值。您说的溶剂化,我理解的是水盒子。

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发表于 Post on 2024-4-20 19:22:27 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-20 12:20
老师,这个反应是气相光解,实验测定值也是气相量子产率值。您说的溶剂化,我理解的是水盒子。

气相光解那就容易一些了,不需要考虑溶剂笼的问题
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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发表于 Post on 2024-4-20 19:23:56 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-20 19:22
气相光解那就容易一些了,不需要考虑溶剂笼的问题

明白了,谢谢老师,那我再学习一下动力学软件。非常感谢您的解答!

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发表于 Post on 2024-4-20 19:52:34 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15689900879@163 于 2024-4-20 19:59 编辑
wzkchem5 发表于 2024-4-20 19:22
气相光解那就容易一些了,不需要考虑溶剂笼的问题

老师,我还有点不明白,以具有稳定构象的T1态为例。T1态经过渡态TS发生断键,光解。过渡态TS仍然是T1态,光解或断键后的产物是否应该是基态呢?会有其他情况吗?
T1态经过渡态TS发生分子内氢转移,其后形成的产物P,应该是激发态还是基态呢?我优化了基态的P,氢又跑回原来的位点了。此时,是否应该仍处于T1态呢?

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发表于 Post on 2024-4-20 21:40:12 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-20 12:52
老师,我还有点不明白,以具有稳定构象的T1态为例。T1态经过渡态TS发生断键,光解。过渡态TS仍然是T1态, ...

如果反应经过了MECP,有可能从MECP从T1回到S0。T1也可以不经历MECP回到S0态,但比较慢。
要确定反应最后体系到底还在不在T1态势能面上,必须把所有相关的ISC速率都算出来
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发表于 Post on 2024-4-20 21:56:02 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-20 21:40
如果反应经过了MECP,有可能从MECP从T1回到S0。T1也可以不经历MECP回到S0态,但比较慢。
要确定反应最后 ...

好的老师,那我查阅相关资料。

老师,我使用普通泛函/def2-tzvp进行结构优化和频率计算;STEOM-DLPNO-CCSD和DLPNO-CCSD/def2-tzvpp计算单点能。S0、S1、T1之间的能量差,耦合簇和普通泛函计算结果差别很大,尤其是S1/T1能差,甚至S1能量会低于T1能量。
我计算了耦合簇/def2-tzvp,普通泛函/def2-tzvpp。
结果发现,耦合簇/def2-tzvp的S1/T1能差 低于 普通泛函/def2-tzvp;普通泛函/def2-tzvpp 与 普通泛函/def2-tzvp结果相近;耦合簇/def2-tzvpp的S1/T1能差为负值。(S1/T1能差为E S1 - E T1)

我不太清楚到底应该用哪个方法算单点能了。

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发表于 Post on 2024-4-20 23:50:55 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-20 14:56
好的老师,那我查阅相关资料。

老师,我使用普通泛函/def2-tzvp进行结构优化和频率计算;STEOM-DLPNO- ...

如果分子已经有共价键发生了均裂,那么最好应该用多参考态方法,比如NEVPT2,次好的是用SF-TDDFT等虽然是单参考方法、但是能正确描述两个强相关电子的方法
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发表于 Post on 2024-4-21 11:43:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15689900879@163 于 2024-4-21 11:48 编辑
wzkchem5 发表于 2024-4-20 23:50
如果分子已经有共价键发生了均裂,那么最好应该用多参考态方法,比如NEVPT2,次好的是用SF-TDDFT等虽然是 ...

老师,分子中羰基C=O键,S1和T1较S0均有所拉长,S0为1.19;S1为1.29;T1为1.30。这种情况算是共价键均裂吗?

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发表于 Post on 2024-4-21 12:48:18 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-20 21:40
如果反应经过了MECP,有可能从MECP从T1回到S0。T1也可以不经历MECP回到S0态,但比较慢。
要确定反应最后 ...

老师,您说的“确定反应最后体系到底还在不在T1态势能面上,必须把所有相关的ISC速率都算出来”。
我理解的是,对于反应物R是在T1态还是S0态发生反应,需要比较R(T1)→R(S0)的ISC速率,R(T1)经TS的反应速率,R(S0)经TS的反应速率的相对大小。
反应在S0态发生:反应物(R-S0态)、过渡态(TS-S0态)、产物(P-S0态)。
反应在T1态发生:反应物(R-T1态)、过渡态(TS-T1态)、产物(P-?态)。【比较困惑P是S0态还是T1态,是计算P(T1)→P(S0)的ISC速率吗?计算后如何判别呢?】

反应在T1态发生,如果P是S0态,是否自旋多重度应该是3?

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发表于 Post on 2024-4-21 16:50:17 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-21 04:43
老师,分子中羰基C=O键,S1和T1较S0均有所拉长,S0为1.19;S1为1.29;T1为1.30。这种情况算是共价键均裂 ...

哦,所以你讨论的不是二溴苯醚那个体系了,我以为你说的还是二溴苯醚。
这种体系S1能量不应该低于T1,建议检查是不是S1和T1的STEOM-DLPNO-CCSD计算自动选取的活性空间不一致
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发表于 Post on 2024-4-21 16:51:55 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-21 05:48
老师,您说的“确定反应最后体系到底还在不在T1态势能面上,必须把所有相关的ISC速率都算出来”。
我理 ...

把反应途径完整地画出来,哪些键断了,哪些键生成了,这些都给出来我们才能回答
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发表于 Post on 2024-4-21 20:09:47 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 15689900879@163 于 2024-4-21 20:22 编辑
wzkchem5 发表于 2024-4-21 16:51
把反应途径完整地画出来,哪些键断了,哪些键生成了,这些都给出来我们才能回答

老师,我简要画了反应1:反应物R(T1_0 1)、过渡态TS(T1_0 1)、中间体IM(S0_0 3)。反应2:中间体IM(S0_0 3)、过渡态TS(S0_0 3)、产物P1和P2(S0_0 1)。
反应1的能垒为3.67 kcal/mol,能变0.99 kcal/mol;反应2的能垒为8.80 kcal/mol。
中间体IM(S0) 0 1 结构优化后,与反应物R(T1)结构一致。我进行了中间体IM(S0) 0 3结构优化。

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发表于 Post on 2024-4-21 21:28:13 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-4-21 13:09
老师,我简要画了反应1:反应物R(T1_0 1)、过渡态TS(T1_0 1)、中间体IM(S0_0 3)。反应2:中间体IM(S0_0 3 ...

这种反应早在20年前就被研究透了,直接查文献即可。
简单来说,如果确定IM的S0态比T1态低,那么在IM附近找S0/T1 MECP,接下来粗略的做法就是假设MECP处的ISC无穷快,然后看S0/T1 MECP是靠近R一侧还是靠近P一侧,如果靠近R一侧,那么认为第一个TS过了以后直接全部ISC到S0;如果靠近P一侧,那么认为IM一开始生成的是T1态,第二步反应途中才发生ISC。
但这里研究的分子太简单了、文献研究太成熟了,如果按以上粗略方法做,很容易被质疑为什么不做非绝热动力学。所以最好还是从R开始做非绝热动力学,很多程序可以做,例如Newton-X、SHARC等
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发表于 Post on 2024-5-6 17:05:57 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-4-20 15:48
T1态的结构是不是有一根C-Br键拉得很长?如果是的,说明这个体系不发磷光,光照会导致C-Br键断裂。你优化 ...

老师,您好!我看到有文章,直接使用DFT 0 3,优化反应物的T1态,并计算反应物(0 3) -> 过渡态(0 3) -> 中间体(0 3)的光解路径。
我不太明白TDDFT 0 1和DFT 0 3,在优化T1态,研究T1态势能面上转化机制,有何区别。
我使用DFT 0 3 优化二溴苯醚,C-Br键未拉长;TDDFT 0 1, C-Br键拉长。

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发表于 Post on 2024-5-6 17:49:33 | 只看该作者 Only view this author
15689900879@163 发表于 2024-5-6 10:05
老师,您好!我看到有文章,直接使用DFT 0 3,优化反应物的T1态,并计算反应物(0 3) -> 过渡态(0 3) ->  ...

https://mattermodeling.stackexch ... -triplets/9357#9357的方法判断两者的区别,以及什么时候用哪种方法
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