IRI map图中，弱氢键和vdw 作用颜色接近，如何区分？

LIFzhou · 发表于 Post on 2022-9-23 15:25:07

请教大家，下图是一个中性分子和离子的IRI map，图中非共价键区域，是弱氢键作用还是vdW作用？弱氢键作用和vdW作用颜色很接近，怎么区分

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-23 21:53:48

C-H...O必定是很弱的氢键
右边虽然是O-H...O氢键，但氢键键角太大，而且H...O的距离也很远，凭常识就知道是极弱的氢键，强度已经是普通范德华作用强度的范畴了，自然相互作用区域电子密度也很小，颜色不可能发蓝

LIFzhou · 发表于 Post on 2022-9-26 13:16:30

sobereva 发表于 2022-9-23 21:53
C-H...O必定是很弱的氢键
右边虽然是O-H...O氢键，但氢键键角太大，而且H...O的距离也很远，凭常识就知道 ...

老师，还想请教一下：
1、作用区域颜色有两个部分，上半部分是蓝色，下半部分是棕色，怎么理解同时有两种颜色？
2、共价键作用区域蓝色部分的形状不同代表什么？

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-27 06:02:52

LIFzhou 发表于 2022-9-26 13:16
老师，还想请教一下：
1、作用区域颜色有两个部分，上半部分是蓝色，下半部分是棕色，怎么理解同时有两 ...

1 轻微棕色没必要特意解释。很深的棕色说明有点互斥成份

2 没必要过度解释

LIFzhou · 发表于 Post on 2022-9-27 12:36:53

sobereva 发表于 2022-9-27 06:02
1 轻微棕色没必要特意解释。很深的棕色说明有点互斥成份

2 没必要过度解释

好的，谢谢老师

虎王 · 发表于 Post on 2022-9-27 13:44:41

IRI本身不能区分范德华作用和氢键吧，只是给出作用位置、作用范围和作用强度信息，然后我们再去推测属于什么作用。

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-28 09:37:06

虎王发表于 2022-9-27 13:44
IRI本身不能区分范德华作用和氢键吧，只是给出作用位置、作用范围和作用强度信息，然后我们再去推测属于什 ...

是的，所以要结合弱相互作用的常识性知识来指认

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[波函数分析求助] IRI map图中，弱氢键和vdw 作用颜色接近，如何区分？