各位大佬，我想模拟结晶水合盐的升温相变过程，用lammps选择GAFF力场可以吗？

okn · 发表于 Post on 2022-9-25 08:15:25

echo          screen
units       real
dimension    3
boundary    p p p
atom_style    full

pair_style    lj/cut/coul/long 8.0 12.0
kspace_style pppm 1.0e-4
bond_style    harmonic
angle_style harmonic
dihedral_style charmm
special_bonds  amber
improper_style cvff

okn · 发表于 Post on 2022-9-25 08:20:06

我看一些文献，GAFF力场与AMBER力场形式完全一样，特别是LJ势参数也是一样，我想问一下我上边的bond_style/angle_style等设置正确吗？

tjuptz · 发表于 Post on 2022-9-25 08:59:44

传统力场对盐的表现不行，相变估计更不行了。看看文献用的啥吧

okn · 发表于 Post on 2022-9-25 14:39:59

tjuptz 发表于 2022-9-25 08:59
传统力场对盐的表现不行，相变估计更不行了。看看文献用的啥吧

感谢回复，我看了一些对于有机盐来说，MD模拟不是很多，有几篇是利用的GAFF力场，还有些是用direding力场和GROMOS 54a8-FF。我现在刚开始学，找到了GAFF力场的势参数。想让大佬看看我的in文件编写对不对？

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Lammps] 各位大佬，我想模拟结晶水合盐的升温相变过程，用lammps选择GAFF力场可以吗？

浏览过的版块