gview打开cif文件的问题？

caofan_success · 发表于 Post on 2017-1-8 22:50:01

晶体结构在计算前也需要优化吗？看文献里面有整体优化的，有只优化氢的，对于金属配合物也有按照最高自旋态优化，然后其他自旋态能量都按照这个优化结果来计算。哪种方式比较合理，还是都要尝试？

sobereva · 发表于 Post on 2017-1-8 23:50:55

caofan_success 发表于 2017-1-8 22:50
晶体结构在计算前也需要优化吗？看文献里面有整体优化的，有只优化氢的，对于金属配合物也有按照最高自旋态 ...

氢必须优化，因为根本实验上没法测，晶体文件里的氢都是经验性地加上去的，根本不准。

看
实验测定分子结构的方法以及将实验结构用于量子化学计算需要注意的问题
http://sobereva.com/569

caofan_success · 发表于 Post on 2017-1-9 11:46:02

sobereva 发表于 2017-1-8 23:50
氢必须优化，因为根本实验上没法测，晶体文件里的氢都是经验性地加上去的，根本不准。

明白，晶体解析软件加氢大都是叫“理论加氢”，在计算的角度看应该是很粗糙的，除非非常精确的测试能直接定出H的位置。
那就是至少要优化氢，如果要求不高的话，主题框架可以用晶体测试得到的坐标来计算，这样理解对不对，sob老师？

sobereva · 发表于 Post on 2017-1-9 11:49:27

caofan_success 发表于 2017-1-9 11:46
明白，晶体解析软件加氢大都是叫“理论加氢”，在计算的角度看应该是很粗糙的，除非非常精确的测试能直接 ...

y

ch3r · 发表于 Post on 2024-3-6 18:26:51

请问一下楼主，是如何用material studio修复的结构呢

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[新手求助] gview打开cif文件的问题？