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[波函数分析求助] 求助使用自旋密度预测反应位点,有些原子上出现了负值

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各位老师,我想通过计算N-1态下的电子自旋密度来预测亲电反应位点,但在计算电子自旋密度时有些原子上出现了负值,看了sob老师的帖子《谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算》,里面提到自旋密度 = Alpha电子密度 - Beta电子密度,所以在计算反应性时,是不是应该看数值的绝对值呢?比如C1的自旋密度是-0.04,C2的自旋密度是0.03,反应性应该是C1>C2吗?

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发表于 Post on 2022-10-8 20:53:07 | 只看该作者 Only view this author
直接比较大小,不取绝对值
不建议用自旋密度。老老实实按照福井函数的定义去计算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-8 21:03:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-8 20:53
直接比较大小,不取绝对值
不建议用自旋密度。老老实实按照福井函数的定义去计算

是因为整体是alpha电子多于beta电子,所以越负越不容易反应吗?尝试过算福井函数,但是和实验对不上,所以想着用Parr函数试一下

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发表于 Post on 2022-10-8 21:38:59 | 只看该作者 Only view this author
试这个没意义

福井函数表现不好当然应该考虑其它的,诸如平均局部离子化能(ALIE)、双描述符等等

静电势与平均局部离子化能相关资料合集 http://bbs.keinsci.com/thread-219-1-1.html
概念密度泛函综述和重要文献合集 http://bbs.keinsci.com/thread-384-1-1.html
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-8 21:51:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-10-8 21:38
试这个没意义

福井函数表现不好当然应该考虑其它的,诸如平均局部离子化能(ALIE)、双描述符等等

好的,谢谢sob老师

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发表于 Post on 2022-10-9 16:26:57 | 只看该作者 Only view this author
快要学会了吧 发表于 2022-10-8 14:03
是因为整体是alpha电子多于beta电子,所以越负越不容易反应吗?尝试过算福井函数,但是和实验对不上,所 ...

(假设你只有一个单电子的话)自旋密度为负表示在这个位点反应会得到三重态的产物。因为反应一般会导致单电子和外来反应物的电子成对,如果你alpha电子比beta电子多,但是外来反应物还是和beta电子成键,那就意味着alpha电子和beta电子数目的差又多了一个。
这种反应比较少见,毕竟alpha电子比beta电子总数多,就使得beta电子占多数的原子几乎不可能是自旋密度绝对值最大的原子。但是也不是不存在,举个简单的例子,有的铁酶催化C-H键活化,会涉及一种中间体,其中有一个高自旋的Fe(III)-OH和一个碳自由基,两者是反铁磁耦合。正常情况下碳自由基会rebound,和羟基成键形成醇,但是假如碳自由基和其他底物进一步反应(比如和底物自身的双键成环)再rebound的话,这就属于alpha电子比beta电子多、但是反应仍然在beta电子占多数的位点上进行的例子。但是此时可以看出基于自旋密度判断反应性的方法失效了,因为Fe上的自旋布居(大约+5)远多于碳上的自旋布居(大约-1)的绝对值,但是反应却在碳上面进行。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-10-10 21:01:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-10-9 16:26
(假设你只有一个单电子的话)自旋密度为负表示在这个位点反应会得到三重态的产物。因为反应一般会导致单 ...

明白了,谢谢老师!

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