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[Multiwfn使用咨询] 求助使用Multiwfn+VMD进行AIM分析,在VMD里输入aim提示无法读取CPs.pdb文件

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老师您好,我已经按照《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)》该文的步骤,成功对AIM.bat进行了具体的编辑,如图 ,然后AIM.txt和AIM.vmd与vmd.rc也按照该文章设置好了。然后双击AIM.bat脚本,成功得到了CPs.pdb、mol.pdb、paths.pdb等文件。但是出现了一个问题,按照文章,理论上现在启动VMD输入aim回车便可以得到AIM图,但是我启动VMD输入aim后却显示,无法读取CPs.pdb文件,如图。且这三个pdb文件是正常文件,直接拖入VMD可以使用。请问老师这是什么原因,该怎么解决呢?

202211052217371349..png (16.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

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发表于 Post on 2022-11-6 09:45:02 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并清楚、准确反映出帖子具体内容,避免有任何歧义和含糊性,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “使用Multiwfn+VMD快速进行AIM分析” 改了,以后务必注意,下次将删帖+扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-11-6 10:18:32 | 只看该作者 Only view this author
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-6 16:36:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-6 09:45
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出 ...

谢谢老师的回复,我下次发帖一定注意规则。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-6 16:36:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-6 10:18
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦

那我现在尝试下,将VMD安装在非默认路径下,谢谢老师。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-6 19:43:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-6 10:18
别把VMD装到默认路径下,此目录又有空格,又可能没有权限在里面创建新文件,自找麻烦

老师,我重新安装的VMD1.9.3老一版本在非默认地址的。配置完成之后在VMD输入aim提示无法读取AIM.vmd文件该怎么解决呢?

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发表于 Post on 2022-11-7 10:16:14 | 只看该作者 Only view this author
18598718812 发表于 2022-11-6 19:43
老师,我重新安装的VMD1.9.3老一版本在非默认地址的。配置完成之后在VMD输入aim提示无法读取AIM.vmd文件 ...

没恰当配置vmd.rc文件,或者脚本文件不在VMD目录下
搞清楚博文里每一个操作的用意、每一个文件的用处、脚本里每行语句的含义,自然就知道怎么回事了
使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图(含视频演示)
http://sobereva.com/445http://bbs.keinsci.com/thread-11079-1-1.html

连视频都提供了,没法解释得更清楚了
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