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[综合交流] 求助,ba2r得到的残基RMSF的值都是0

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我在根据课程验证我所做的模拟是否合理时,针对模拟结果计算了RMSF之后,又使用ba2r工具获取初始蛋白质残基的RMSF,结果得到的rmsf-atomic.txt和rmsf-residue.txt的值均为0,请问我是哪一步出了问题

202211161016484378..jpg (600.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

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发表于 Post on 2022-11-16 21:00:55 | 只看该作者 Only view this author
输入的pdb文件有问题,没具体文件没法说
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-17 09:18:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 qingqingdong 于 2022-11-17 09:23 编辑
sobereva 发表于 2022-11-16 21:00
输入的pdb文件有问题,没具体文件没法说

感谢回复,我的pdb文件是从库里下载的,麻烦您看一下哪里有问题

1ba4.pdb

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发表于 Post on 2022-11-17 17:12:23 | 只看该作者 Only view this author
qingqingdong 发表于 2022-11-17 09:18
感谢回复,我的pdb文件是从库里下载的,麻烦您看一下哪里有问题

pdb是NMR测的,根本没有B因子
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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