求助：掺杂类XRD数据如何导出第一性原理可以跑的cif文件

sjc · 发表于 Post on 2022-11-23 11:26:36

各位老师好，我想请教一个问题。
我用GSAS软件精修后导出一个cif文件后。将cif文件导入到vesta查看可以看到两个原子占据同一个位置，sob老师的multiwfn软件无法识别该cif文件，由此就没有办法进行第一性原理计算，我想请问一下，是通过ms手动修改一下还是有其他的办法吗，我想手动修改的话应该会改变键长，另外修改之后是否需要跑优化结构任务，还是直接跑单点能或者过渡态？

renzhogn424 · 发表于 Post on 2022-11-23 13:03:05

好像直接进VESTA里面去改占据数就行。。。。不会动到键长的。

sjc · 发表于 Post on 2022-11-23 14:28:35

renzhogn424 发表于 2022-11-23 13:03
好像直接进VESTA里面去改占据数就行。。。。不会动到键长的。

需要跑优化吗

lcq845402558 · 发表于 Post on 2022-11-23 17:27:41

合金有合金的建模方式。可以看看ATAT，sqs，sae这些。简单算的话VCA也可以。

renzhogn424 · 发表于 Post on 2022-11-24 17:23:25

sjc 发表于 2022-11-23 14:28
需要跑优化吗

一般都要跑的

DDT好好吃 · 发表于 Post on 2024-4-14 23:16:35

lcq845402558 发表于 2022-11-23 17:27
合金有合金的建模方式。可以看看ATAT，sqs，sae这些。简单算的话VCA也可以。

小白请问老师sqs和sae，VCA用的是什么软件啊？谢谢

lcq845402558 · 发表于 Post on 2024-4-16 09:51:08

DDT好好吃发表于 2024-4-14 23:16
小白请问老师sqs和sae，VCA用的是什么软件啊？谢谢

sqs和sae差不多主要是建立结构的code。
SQS special quasirandom structure 具体可以看ATAT手册或者魏苏淮老师的文章。
SAE similar atomic environment 具体可以查看J. Chem. Phys. 153, 034101 (2020)
VCA虚晶近似是一种计算方法，不过好像认可度一般。MS， VASP， Pwmat等常见的软件应该都能用.

DDT好好吃 · 发表于 Post on 2024-4-16 22:23:14

lcq845402558 发表于 2024-4-16 09:51
sqs和sae差不多主要是建立结构的code。
SQS special quasirandom structure 具体可以看ATAT手册或者魏苏 ...

感谢！！！

Demons · 发表于 Post on 2024-10-22 15:28:16

可以向您请教一下吗，我最近也遇到了同样的问题

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[建模与可视化] 求助：掺杂类XRD数据如何导出第一性原理可以跑的cif文件