sobMECP遇到的问题

三与三十万 · 发表于 Post on 2022-11-23 22:40:24

各位老师好，我想计算大分子的MECP应该具体怎么实施呢？我有看完博文http://sobereva.com/286，发现程序适合在主节点上交作业，那么我如果要算大的体系的话，应该用大核数，怎样更改程序中的设置，实现队列作业呢？目前，我已经更改了环境变量和运行脚本，执行runfirst.sh可正常运算Job0_A.log Job0_B.log，但是最后执行runMECP出问题，在产生Job1_A.gjf ，Job1_B.gjf 文件后，无法继续运算，请问我应该怎么修改呢？

Kalinite · 发表于 Post on 2022-11-24 11:33:02

你应该把sobMECP作为一个作业提交到队列系统，而不是让sobMECP去提交Gaussian的作业，这样sobMECP每次成功提交“sg16m xxx.gjf”到队列系统后，就认为算完了，但实际上只是交了作业。

三与三十万 · 发表于 Post on 2022-11-24 15:46:49

Kalinite 发表于 2022-11-24 11:33
你应该把sobMECP作为一个作业提交到队列系统，而不是让sobMECP去提交Gaussian的作业，这样sobMECP每次成功 ...

请问应该怎么把sobMECP作为一个作业进行提交呢

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-24 17:01:47

三与三十万发表于 2022-11-24 08:46
请问应该怎么把sobMECP作为一个作业进行提交呢

仿照提交高斯任务的脚本写法，但是把其中设置高斯的环境变量的命令换成设置sobMECP的环境变量的命令（如果有的话），运行高斯的命令换成运行sobMECP的命令

三与三十万 · 发表于 Post on 2022-11-24 17:23:45

wzkchem5 发表于 2022-11-24 17:01
仿照提交高斯任务的脚本写法，但是把其中设置高斯的环境变量的命令换成设置sobMECP的环境变量的命令（如 ...

我还是不太理解，可以举例说明一下么？您是怎么修改高斯的脚本的？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-11-24 17:58:30

三与三十万发表于 2022-11-24 10:23
我还是不太理解，可以举例说明一下么？您是怎么修改高斯的脚本的？

把高斯任务提交队列的脚本是谁写的？
如果是你自己写的，你理应会举一反三写出提交sobMECP的脚本；
如果不是你写的，找那个写脚本的人教你

三与三十万 · 发表于 Post on 2022-11-24 20:08:18

wzkchem5 发表于 2022-11-24 17:58
把高斯任务提交队列的脚本是谁写的？
如果是你自己写的，你理应会举一反三写出提交sobMECP的脚本；
如 ...

我还是不太理解source sobMECP的脚本文件时应该怎么写

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