在vesta里面O与H之前存在虚线代表什么意思？

fight · 发表于 Post on 2023-2-19 15:15:44

请教一下，几何结构优化收敛后，在vesta里面O与H之前存在虚线

，代表什么意思？

sobereva · 发表于 Post on 2023-2-19 15:42:48

如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “vesta可视化” 改了，以后务必注意

乐平 · 发表于 Post on 2023-2-19 18:24:49

可能是氢键？

fight · 发表于 Post on 2023-2-19 19:31:00

乐平发表于 2023-2-19 18:24
可能是氢键？

谢谢您的回复！我也认为是氢键，优化之前没有虚线存在，是O和H之间没有达到氢键的键长吗？

John_Tao · 发表于 Post on 2023-4-12 11:36:51

fight 发表于 2023-2-19 19:31
谢谢您的回复！我也认为是氢键，优化之前没有虚线存在，是O和H之间没有达到氢键的键长吗？

那个虚线应该就是表示氢键，VESTA会按照距离判定氢键。应该是优化后距离变近了，你可以量一下。

fight · 发表于 Post on 2023-4-12 15:14:26

John_Tao 发表于 2023-4-12 11:36
那个虚线应该就是表示氢键，VESTA会按照距离判定氢键。应该是优化后距离变近了，你可以量一下。

好嘞谢谢！

1285050231 · 发表于 Post on 2024-9-24 09:24:50

fight 发表于 2023-4-12 15:14
好嘞谢谢！

同学，这个氢键判定标准可以修改吗？我发现有的分子内部也形成氢键，这明显不合理。

乐平 · 发表于 Post on 2024-9-24 09:39:41

1285050231 发表于 2024-9-24 09:24
同学，这个氢键判定标准可以修改吗？我发现有的分子内部也形成氢键，这明显不合理。

图形显示阮经理的任何 “键” 其实都不是真的键，只是连接方式，当然可以任意修改。

你想修改，那么梳理一下逻辑。
1. 修改就是“编辑”，所以找到 Edit
2. 修改键，所以找 Bonds
3. 修改氢键，所以选择和氢键相关的原子，H, O 之类的，所以要点击相关的原子
4. 修改所谓的“化学键”，本质上是 “成键范围”，也就是 “原子间的距离”，所以要修改距离的数值大小

有了上述逻辑，就很好找

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[建模与可视化] 在vesta里面O与H之前存在虚线代表什么意思？