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[综合交流] 多组份间相互作用能计算公式

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楼主
用MD模拟了含4种组份(A,B,C,D)的体系,想计算EA-B的相互作用能,不知下面的计算公式是否正确:

    EA-B = Esys - EA - EB - EC - ED - (EA-C+EA-D+EB-C+EB-D+EC-D+EA-BCD+EB-ACD+EC-ABD+ED-ABC)

同一水平 同一精度下

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发表于 Post on 2016-6-29 21:53:40 | 只看该作者 Only view this author
你搞得太复杂了。

如果已经跑出了轨迹,想研究轨迹中A-B的相互作用能,就直接计算E(A-B)就完了,用不着那么相减。因为一般用的分子力场都是对势,而不像量化那样需要考虑多体耦合。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-29 22:25:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-29 21:53
你搞得太复杂了。

如果已经跑出了轨迹,想研究轨迹中A-B的相互作用能,就直接计算E(A-B)就完了,用不着 ...

基础啊!!!  对势 对势!!

这两种公式计算的能量之间有一定的差别 但误差很小 想知道误差愿意是什么呢

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发表于 Post on 2016-6-30 04:51:50 | 只看该作者 Only view this author
cgchen 发表于 2016-6-29 22:25
基础啊!!!  对势 对势!!

这两种公式计算的能量之间有一定的差别 但误差很小 想知道误差愿意是什 ...

这属于一些琐碎计算细节的事,没有具体情况不好说。反正你就直接计算A-B相互作用能就够了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-6-30 08:34:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-6-30 04:51
这属于一些琐碎计算细节的事,没有具体情况不好说。反正你就直接计算A-B相互作用能就够了

哦了 谢谢sob老师

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