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[CP2K] 使用cp2k计算CO2与TTCOF之间不同吸附模式,优化后的结构变为CO2分子与TTCOF,应当...

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我想使用cp2k计算出如下图的CO2不同吸附模型,但是我在CELL-OPT后没有得到下图1 b所示的结构,而是图2的结构请问是哪里出了问题,该如何修改。氧端吸附的cif文件、输入文件和输出文件已放在链接处,希望得到大家的回复。


CO2的不同吸附模型.png (202.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

图1 CO2的不同吸附模型

图1 CO2的不同吸附模型

Zn-O-opt.png (68.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

图2 O端吸附CELL-OPT后的结构

图2 O端吸附CELL-OPT后的结构

Zn-O.inp

12.37 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

O端吸附的输入文件

Zn-O.log

150.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

O端吸附的输出文件

Zn-O.cif

14.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

O端吸附的cif文件

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发表于 Post on 2023-4-11 12:18:41 | 只看该作者 Only view this author
没必要变胞优化
建议用MT做XY二维周期性计算,这样Z方向还能用更小真空区节约耗时,还完全避免和Z的镜像相互作用

其它方面没有明显问题。我不清楚文献具体用什么程序什么级别算的,你可以尝试不同CO2初始位置,和更高档次的基组
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-11 13:03:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-11 12:18
没必要变胞优化
建议用MT做XY二维周期性计算,这样Z方向还能用更小真空区节约耗时,还完全避免和Z的镜像相 ...

好的,谢谢老师,我下午试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-11 14:27:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-11 12:18
没必要变胞优化
建议用MT做XY二维周期性计算,这样Z方向还能用更小真空区节约耗时,还完全避免和Z的镜像相 ...

文献中用的是Materials Studio软件
所有的 DFT 计算均使用 Materials Studio 软件的 DMol3 模块进行。电子交换和相关用广义梯度近似 (GGA)与 Perdew, Burke 和 Ernzerhof(PBE)泛函进行了近似。设置总能量收敛准则为收敛到 1 × 10-5 Ha,设定最大力为 0.002 Ha,原子的最大位移小于 0.005 Å。为了提高计算性能,采用了 0.005 Ha 的费米涂抹法。

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