基于Multiwfn的分子机器学习助手：MultiwfnMLhelper

不务正业化学人

老师您好，我将压缩包中的内容全部复制到包含多个.fchk文件的文件夹中，双击.exe文件后有如下报错，同时生成了一个空的csv文件，我的Multiwfn可以正常导入fchk文件，请问我如何解决~

天天121

老师您好，我再计算的时候发现有的分子会报错，有的会正常生成csv文件，请问这种情况怎么处理呢？
      ***  The 'Multiwfn_noGUIMLhelper' script (Linux) started at 2024-10-12 22:10:38  ***

Total 2 '*.input' files were found.
Using Multiwfn_noGUI to calculate various descriptors...

[#########################-------------------------] 50.00% (     1 /      2)
[##################################################] 100.00% (     2 /      2)

Error: not enough values to unpack (expected 4, got 2)
Note that: (1) The "isilent= 1" MUST be set in the settings.ini of Multiwfn_noGUI.
           (2) Multiwfn_noGUI can be DIRECTLY called by using the "Multiwfn_noGUI" command.

      ***  The 'Multiwfn_noGUIMLhelper' script (Linux) terminated at 2024-10-12 22:39:34  ***

>> Elapsed time:  0 day(s)  0 hour(s) 28 minute(s) 55.96 second(s) <<

天天121

Roderick07 发表于 2024-4-15 11:16
问题已解决，我自己没有设置好相关参数

同学请问您这个问题是如何解决的 我也遇到这个问题了
Total 2 '*.input' files were found.
Using Multiwfn_noGUI to calculate various descriptors...

[#########################-------------------------] 50.00% (     1 /      2)
[##################################################] 100.00% (     2 /      2)

Error: not enough values to unpack (expected 4, got 2)

liu1216081301

向各位大神学习，不断进步

yumingsuxmu

看报错应该是在这里设置，具体应该查查Multiwfn手册了解一下，很快会有新的程序出来

天天121

yumingsuxmu 发表于 2024-10-17 08:53
看报错应该是在这里设置，具体应该查查Multiwfn手册了解一下，很快会有新的程序出来

十分感谢你的回复，我把Multiwfn重新装了一下不知道能不能行，期待您的新程序！

QiuQian

老师您好，这个一个fchk文件运行的时间大概是多少合适，感觉等了好久

yumingsuxmu

不应该超过一个小时，加入一个小分子在正常电脑的话

非洲黑炭

你好 ！想请问下计算后 只有txt输出文件，没有描述符信息汇总是为啥

sjkcn

liyuanhe211 发表于 2023-4-12 11:41
帮楼主列一下脚本能提取出哪些描述符：

老师，我想问下。Ionization energy, electron affinity, hardness, electronegativity, electrophilicity 这些对应您代码的哪个参数

Whitedwarf

整理了一下提取的描述符的单位，不知道是否匹配
基本分子信息
1. 原子数量 (atom_num) 无单位
2. 分子量 (weight) Da
3. HOMO能量和轨道编号 (homo, homo_number) energy: a.u.
4. LUMO能量 (lumo) energy: a.u.  
5. HOMO-LUMO能隙 (homo_lumo_gap) a.u.
轨道离域化指数 (ODI)
6-9. ODI值 (odi_homo_1, odi_homo, odi_lumo, odi_lumoadd1) 无单位
分子形状参数
10. 最远距离 (farthest_distance) Angstrom
11. 分子半径 (mol_radius) Angstrom
12. 分子三边长度 (mol_size) Angstrom
13. 分子平面度参数 (mpp) Angstrom
14. 平面偏差跨度 (sdp) Angstrom
15. 偶极矩 (dipole_moment)  Debye
16. 四极矩 (quadrupole_moment) e·a₀²
17. 八极矩 (octopole_moment) e·a₀3
18. 体积 (volume) Bohr^3
19. 密度 (density) g/cm^3
20. ESP最小值和最大值 (espmin, espmax) kcal/mol
21. 整体表面积 (overall_surf_area) Bohr^2
22. 正表面积 (pos_surf_area) Bohr^2
23. 负表面积 (neg_surf_area) Bohr^2
24. 整体平均值 (overall_ave) a.u.
25. 正平均值 (pos_ave) a.u.
26. 负平均值 (neg_ave) a.u.
27. 整体方差 (Over_var) a.u.^2
28. 电荷平衡 (nu) 无单位
29. 内部电荷分离 (Pi) a.u.
30. 分子极性指数 (MPI) eV
31. 非极性表面积比例 (nonpolar_area) %
32. 极性表面积比例 (polar_area) %
33. ALIE最小值和最大值 (aliemin, aliemax) eV
34. ALIE平均值 (alie_ave) a.u.
35. ALIE方差 (alie_var) a.u.^2
36. LEA最小值和最大值 (leamin, leamax) eV
37. LEA平均值 (lea_ave) a.u.
38. LEA方差 (lea_var) a.u.^2

facia

你好，请问这个exe文件是不是没有办法直接生成CSV表格呀？我使用exe文件只生成了txt文件