求助，自己使用CP2K计算出的HOMO-LUMO gap与文章提供的数据差别很大

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-8 00:04:57

本帖最后由不会扣篮的后卫于 2023-5-8 00:08 编辑

各位老师好，我在用Multiwfn读取3个不同体系的并五苯cif（1x1x1,2x1x1和2x2x2)，生成3个CP2K输入文件后用PBE泛函跑单点能的计算。得到输出molden文件，在Multiwfn打开后发现三个体系的HOMO-LUMO gap值接近 1eV，

与文章中给出的理论计算参考的并五苯HOMO-LUMO gap值2.2eV相比，差距很大。

同时我也使用了Quantum Espresso来计算并五苯cif（1x1x1,2x1x1和2x2x2)的HOMO-LUMO gap值。
把文章作者在PYXAID程序中的的输入文件参数设置，PBE泛函， ecutwfc= 40，ecutrho = 400和gamma点
搬到Quantum Espresso的输入文件中。Quantum Espresso跑出来的输出HOMO-LUMO gap值也是接近 1eV。

有两个问题需要向各位老师请教。
1.请问老师，为什么PYXAID程序算出来的HOMO-LUMO gap值与CP2K和Quantum Espresso的值差距很大
或者说怎么修改输入文件参数可以使HOMO-LUMO gap值接近2.2eV呢？
2.为什么随着体系增加，HOMO-LUMO gap值会逐渐减小？（附上相关文件）

Deepast · 发表于 Post on 2023-5-8 03:29:26

你就直接算个scf，优化都没做...
你要是拿文章的结构那还凑合，但你给出的结构和文章的差那么多
“The resulting unit cell parameters are the following: a = 16.134 Å, b = 4.615 Å, c = 9.904 Å, α =62.1°, β = 93.6°, γ = 93.2°.”
另外你这个扩胞很迷
能用原胞就用原胞算

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-8 07:12:36

PBE这样的纯泛函算出来的gap本来就严重偏低，要更好结果可以用CP2K做HSE06计算

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-10 11:56:12

sobereva 发表于 2023-5-8 07:12
PBE这样的纯泛函算出来的gap本来就严重偏低，要更好结果可以用CP2K做HSE06计算

谢谢卢老师的建议，我去用HSE06去跑一下。

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-10 12:02:02

本帖最后由不会扣篮的后卫于 2023-5-10 21:52 编辑

Deepast 发表于 2023-5-8 03:29
你就直接算个scf，优化都没做...
你要是拿文章的结构那还凑合，但你给出的结构和文章的差那么多
“The re ...

谢谢老师的建议。这三个cif是之前优化好的结构。我不打算用文章的结构，主要是打算用这三个cif结构来计算出HOMO-LUMO gap，然后和文章中的HOMO-LUMO gap作比较。但是没想到差这个么多

。先按照卢老师的建议去跑了。

Deepast · 发表于 Post on 2023-5-10 14:16:47

不会扣篮的后卫发表于 2023-5-10 12:02
谢谢的老师建议。这三个cif是之前优化好的结构。我不打算用文章的结构，主要是打算用这三个cif结构来计算 ...

优化过了那就没啥问题，直接拿去算HSE06就行

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-16 21:28:24

sobereva 发表于 2023-5-8 07:12
PBE这样的纯泛函算出来的gap本来就严重偏低，要更好结果可以用CP2K做HSE06计算

卢老师，您好。我按照您的建议使用杂化泛函HSE06跑单点能计算，输入文件为1x1x1体系，由72个原子组成的的并五苯结构，基组为6-31G*。但是输出文件显示很难完成收敛。请问卢老师有什么建议吗？我附上输入和输出文件供您参考。

sobereva · 发表于 Post on 2023-5-16 22:28:26

不会扣篮的后卫发表于 2023-5-16 21:28
卢老师，您好。我按照您的建议使用杂化泛函HSE06跑单点能计算，输入文件为1x1x1体系，由72个原子组成的的 ...

解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665（http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html）

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-17 12:07:10

sobereva 发表于 2023-5-16 22:28
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665（http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html）

谢谢卢老师！

xinlixi · 发表于 Post on 2023-5-23 22:56:55

不会扣篮的后卫发表于 2023-5-17 12:07
谢谢卢老师！

解决问题了吗？我也是同样问题，你用HSE06跑，结果正确吗？

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-24 07:38:16

xinlixi 发表于 2023-5-23 22:56
解决问题了吗？我也是同样问题，你用HSE06跑，结果正确吗？

CP2K参数要改太多了，还没有跑出来。

xinlixi · 发表于 Post on 2023-5-24 09:59:09

不会扣篮的后卫发表于 2023-5-24 07:38
CP2K参数要改太多了，还没有跑出来。

谢谢！跑出来后，请麻烦告诉一下结果。我们的问题跟你一模一样，vasp跑出来的结果带隙大，cp2k用PBE带隙小，另外dos曲线也跟vasp不一样

不会扣篮的后卫 · 发表于 Post on 2023-5-27 03:18:59

本帖最后由不会扣篮的后卫于 2023-5-27 03:22 编辑

xinlixi 发表于 2023-5-24 09:59
谢谢！跑出来后，请麻烦告诉一下结果。我们的问题跟你一模一样，vasp跑出来的结果带隙大，cp2k用PBE带隙 ...

你好，可以先用GGA（比如PBE纯泛函）收敛系统，然后用HFX的波函数重启文件实现连续运行（SCF_GUESS RESTART）。我先使用了PBE纯泛函算出1x1x1_unit_cell_relax-RESTART.wfn,然后在HSE06杂化泛函的输入文件里 WFN_RESTART_FILE_NAME 参数后面加入PBE-RESTART.wfn（记得1x1x1_unit_cell_relax-RESTART.wfn也改名PBE-RESTART.wfn，然后放在同一路径下），然后取消输入文件里SCF_GUESS RESTART 前面的注释。外加增加了一些新的参数和用了一些新的BASIS和POTENTIALS，最后算出来合适的HOMO-LUMO gap。
（附上相应的文件供你参考）。

xinlixi · 发表于 Post on 2023-5-27 09:40:19

不会扣篮的后卫发表于 2023-5-27 03:18
你好，可以先用GGA（比如PBE纯泛函）收敛系统，然后用HFX的波函数重启文件实现连续运行（SCF_GUESS RESTART ...

xiexie , 看来还是PBE精度太低

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