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楼主 Author: Shana
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[综合讨论] Dynaphopy 计算高温声子谱

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-3 21:12:48 | 只看该作者 Only view this author
mly 发表于 2025-1-24 23:14
想请教您一下,我想计算300K下的吉布斯自由能,我需要在AIMD的INCAR中设置300K,在使用phonopy提取热力学性 ...

phonopy的300k自由能可以通过自由能的定义去算,即考虑T*S部分,S 是熵,和声子有关,phonopy可以根据声子谱计算出熵。当然,考虑到温度对声子的影响,phonopy支持QHA方法来计算有限温的自由能。建议看看phonopy的例子部分https://phonopy.github.io/phonopy/examples.html,以及理论部分https://phonopy.github.io/phonop ... perties-expressions

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发表于 Post on 2025-2-14 09:46:22 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-2-3 21:12
phonopy的300k自由能可以通过自由能的定义去算,即考虑T*S部分,S 是熵,和声子有关,phonopy可以根据声 ...

感谢

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发表于 Post on 2025-2-17 17:48:34 | 只看该作者 Only view this author
请问非谐性声子谱的数据怎么像phonopy一样导出呢?我需要用它们计算后续内容,感谢!还有我觉得这个声子谱似乎有些奇怪,请问它正常吗?这是2000k下的

Figure_1.png (171.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-22 12:02:43 | 只看该作者 Only view this author
高阁 发表于 2025-2-17 17:48
请问非谐性声子谱的数据怎么像phonopy一样导出呢?我需要用它们计算后续内容,感谢!还有我觉得这个声子谱 ...

dynaphopy input OUTCAR -sfc FORCE_CONSTANTS   这个指令会给出修正后的力常数,然后用phonopy画出修正后的声子谱

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发表于 Post on 2025-2-23 11:09:22 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-2-22 12:02
dynaphopy input OUTCAR -sfc FORCE_CONSTANTS   这个指令会给出修正后的力常数,然后用phonopy画出修正 ...

谢谢

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发表于 Post on 2025-2-24 21:11:53 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yuanzhe 于 2025-2-25 14:56 编辑

shana老师,用vasp跑aimd需要用phonopy扩胞的POSCAR进行计算吗?kpoints是直接vaspkit还是手动设置吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-2-25 17:28:27 | 只看该作者 Only view this author
yuanzhe 发表于 2025-2-24 21:11
shana老师,用vasp跑aimd需要用phonopy扩胞的POSCAR进行计算吗?kpoints是直接vaspkit还是手动设置吗?

扩胞系数要和phonopy的系数一样,不然结果会有问题。晶胞比较大的话(扩胞系数比较大),用单k点就很好了。

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发表于 Post on 2025-3-3 15:47:09 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-2-25 17:28
扩胞系数要和phonopy的系数一样,不然结果会有问题。晶胞比较大的话(扩胞系数比较大),用单k点就很好了 ...

谢谢shana老师解惑,我一般扩2*2*2,用vaspkit生成的就可以了嘛

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-3-5 15:22:35 | 只看该作者 Only view this author
yuanzhe 发表于 2025-3-3 15:47
谢谢shana老师解惑,我一般扩2*2*2,用vaspkit生成的就可以了嘛

可以,phonopy也可以扩胞。phonopy扩完胞后,会有一个SPOSCAR,这个是未做位移的supercell。

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发表于 Post on 2025-3-11 15:19:42 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-3-5 15:22
可以,phonopy也可以扩胞。phonopy扩完胞后,会有一个SPOSCAR,这个是未做位移的supercell。

谢谢shana老师!!!

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发表于 Post on 2025-4-8 22:56:06 | 只看该作者 Only view this author
请问什么命令可以导出能在origin里画图的声子数据文件呀

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-11 09:32:30 | 只看该作者 Only view this author
Autumn899 发表于 2025-4-8 22:56
请问什么命令可以导出能在origin里画图的声子数据文件呀

先保存重整后的力常数,然后用phonopy计算声子谱,导出dat数据

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发表于 Post on 2025-4-11 17:01:24 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-4-11 09:32
先保存重整后的力常数,然后用phonopy计算声子谱,导出dat数据

好的!

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发表于 Post on 2025-6-16 08:59:06 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cdx 于 2025-6-16 09:00 编辑

老师 请问利用Dynaphopy可以得到声子寿命吗?已完成非谐计算,需要如何导出声子寿命数据,求指导

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发表于 Post on 2025-6-16 15:03:13 | 只看该作者 Only view this author
Shana 发表于 2025-2-22 12:02
dynaphopy input OUTCAR -sfc FORCE_CONSTANTS   这个指令会给出修正后的力常数,然后用phonopy画出修正 ...

老师你好,请问可以正常获得非谐修正后的力常数,可以利用phonopy导出声子寿命数据吗

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