CI-NEB方法寻找过渡态，插入的构象能量变化。。。

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2016-7-21 11:11:28

如图，我插入了8个构象，EDIFFG设置为-0.03，执行nebresults.pl脚本后得出的能量变化图，初末态之间是不是没有过渡态呢？？或者我要不对哪个点坐下频率计算验证下虚频情况？？求指点

Aristotler · 发表于 Post on 2017-5-9 19:42:24

首先，你这个初始态的结构就有问题，没有优化好吧？

灰飞的旋律 · 发表于 Post on 2017-5-19 10:25:46

Aristotler 发表于 2017-5-9 19:42
首先，你这个初始态的结构就有问题，没有优化好吧？

我这帖子都一年了，也能翻出来

晨曦 · 发表于 Post on 2017-6-6 11:29:49

今天我又翻出来了

晨曦 · 发表于 Post on 2017-6-6 11:34:28

我没有得到你这个图，原因应该是没有找到gnuplot ，不知道哪位高手指点一下如何解决。

谢过先

ztchem · 发表于 Post on 2017-6-6 22:35:50

是不是初末态的结构没有优化好？计算中表面重构很严重？模型构建不合理？

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[VASP] CI-NEB方法寻找过渡态，插入的构象能量变化。。。