请问如何求Cα 原子的实际均方涨落和交叉相关涨落

valiente1 · 发表于 Post on 2023-6-15 16:49:33

本帖最后由 valiente1 于 2023-6-16 16:14 编辑

我想算 Cα 原子的实际均方涨落和交叉相关涨落，先计算了体系的协方差矩阵，按道理说，对角线元素应该是残基 i 的均方涨落（MSF），非对角线是残基 i 和 j 之间的交叉相关涨落（CoF）。然后我求了Cα原子的 RMSF, 发现 MSF 和 RMSF 不是倍数关系，请问大家，是计算有问题吗，怎么才能求出 Cα 原子的实际 MSF 和 CoF 呢

Heyjay · 发表于 Post on 2024-10-20 22:18:06

请问一下协方差矩阵您是怎么计算的，还有MSF和RMSF不是一个东西吗？

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