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[CP2K] 关于CP2K中自相互作用校正(SIC)的参数设置和结果的问题

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楼主
各位小哥哥,各位大佬们,请教一个问题呀~
是这样的,我研究的是一个丙酮酸分子在一个含有水合电子的水团簇中的体系,为了比较准确的描述水合电子和丙酮酸之间的相互作用,我参考了文献“A molecular dynamics study of the hydroxyl radical in solution applying self-interaction-corrected density functional methods”中的研究使用一个自旋密度自相互作用校正(SD-SIC)方法。我用的泛函是BLYP-D3(BJ),基组是TZV2P-GTH。
根据参考文献“Degradation of Per- and Polyfluoroalkyl Substances with Hydrated Electrons: A New Mechanism from First-Principles Calculations”中的方法,确定SD-SIC方法中SIC_SCALING_A和SIC_SCALING_B参数的数值,要通过所研究体系关键物种的垂直电子亲和能(VEA)来确定。
因此我的研究思路是:先通过Gaussian优化丙酮酸分子结构(b3lyp/def2tzvp+D3(BJ)),在分别计算丙酮酸的单点能和带-1电荷丙酮酸的单点能(CCSD(T)/AUG-cc-pVTZ),得到丙酮酸单点能-341.9286534 a.u.以及带-1电荷丙酮酸的单点能-341.9261644 a.u.(三者文件名分别为B3LYP-opt.gif、CCSD-sp.gif、CCSD-1-sp.gif)。
然后我在CP2K中用Gaussian优化好的结构分别计算丙酮酸的单点能(-67.3296633424807 a.u.)和带-1电荷丙酮酸的单点能(两者者文件名分别为cp2k-Pyruvate_SP.inp、cp2k-Pyruvate-1_SD-SIC_SP.inp),其中设置的SIC部分的关键词和参数为:
    &TDDFPT
      &SIC
        SIC_METHOD AD
        SIC_SCALING_A 0.2
        SIC_SCALING_B 0
      &END SIC
    &END TDDFPT

然后,奇怪的情况发生了,无论我如何改变SIC_METHOD、SIC_SCALING_A和SIC_SCALING_B,所得到的结果都完全相同!!!为-67.3497019097407 a.u.,就很离谱,我不明白会出现这种情况的原因是什么?为什么我无论如何改变SIC参数设置计算得到的单点能结果都相同?是我输入文件哪里写错了还是我对该方法的理解有错误?请各位小哥哥,各位大佬们指点指点迷津好吗?o(╥﹏╥)o

Pyruvate.out

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CP2K输出文件

cp2k-Pyruvate-1_SD-SIC_SP.inp

3.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

cp2k-Pyruvate_SP.inp

3.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

B3LYP-opt.gjf

748 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

CCSD-sp.gjf

705 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

CCSD-1-sp.gjf

706 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 0

Degradation of Per- and Polyfluoroalkyl Substances with Hydrated Electrons A New.pdf

4.93 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

A molecular dynamics study of the hydroxyl radical in solution applying self-int.pdf

809.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

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发表于 Post on 2023-6-20 03:08:09 | 只看该作者 Only view this author
如果模拟总时间不很长、体系不很大,与其折腾这个,不如直接用杂化泛函跑
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-21 10:11:19 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 gingaorb 于 2023-6-21 10:14 编辑
sobereva 发表于 2023-6-20 03:08
如果模拟总时间不很长、体系不很大,与其折腾这个,不如直接用杂化泛函跑

体系191个水分子模拟时间估计在20 ps左右,担心用B3LYP或者PBE0可能跑不动~o(╥﹏╥)o,请问站长大大有没有什么好的建议吗?

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发表于 Post on 2023-6-21 13:59:11 | 只看该作者 Only view this author
gingaorb 发表于 2023-6-21 10:11
体系191个水分子模拟时间估计在20 ps左右,担心用B3LYP或者PBE0可能跑不动~o(╥﹏╥)o,请问站长大大有没 ...

先跑起来试试,根据跑10步以后的平均每步耗时估计总耗时是否能接受。
要么联系文章作者要输入文件,并且表示会引用他们的文章,很可能直接给你
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