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楼主 Author: liyuanhe211
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[综合交流] 各来源谐振校正因子汇总表格

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发表于 Post on 2021-3-26 13:51:41 | 只看该作者 Only view this author
这些校正因子里面,既没有含D3校正的,也没有含溶剂模型的。那么在B3LYP/6-311G** em=GD3BJ opt freq scrf=SMD 后,用Shermo程序算热力学量时,sclZPE=应该给什么值?0.9888 还是 1.0 ? 群里社长回答说取1.0,我还是不太懂原因,为什么取1.0 呢?所以在这里再问一问,也许别的朋友也会有同样的疑问。谢谢解答。

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发表于 Post on 2021-3-26 16:42:26 | 只看该作者 Only view this author
lanthanum 发表于 2021-3-26 13:51
这些校正因子里面,既没有含D3校正的,也没有含溶剂模型的。那么在B3LYP/6-311G** em=GD3BJ opt freq scrf= ...

D3校正和溶剂模型可以近似认为不影响校正因子,因为这两者主要影响低频振动,而校正因子只有对高频振动是可靠的,对于低频振动无论如何都不可能用一个固定的校正因子校正准。
我个人觉得两个都可以,用前者就是假设D3校正和溶剂模型的效应可以忽略不计,用1.0相当于是稍微牺牲一点精度来减少整个计算过程的经验性,两者都有道理。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-9-25 10:31:37 | 只看该作者 Only view this author
请问一下Truhlar算是哪类来源,参考文献应该怎么引

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发表于 Post on 2021-12-7 23:00:31 | 只看该作者 Only view this author
dx.doi.org/10.1021/jp508422u | J. Phys. Chem. A 2015, 119, 1701−1714
这里好像更新了一批带def2系列的基频和ZPE校正因子

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发表于 Post on 2021-12-24 21:21:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-3-10 23:19
新的一批校正因子:DOI: 10.1021/acs.jpca.6b12147

老师,我查下面文章中的校正因子,但是优化和频率用的M06/6-31G*,没有这个校正因子,可以M06/6-31G**的替代计算吉布斯自由能吗?

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发表于 Post on 2021-12-25 18:30:30 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2021-12-24 21:21
老师,我查下面文章中的校正因子,但是优化和频率用的M06/6-31G*,没有这个校正因子,可以M06/6-31G**的 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2022-4-23 16:04:09 | 只看该作者 Only view this author
楼主您好!非常感谢您的分享!有一个问题想和您请教一下。请问在表中来源那块儿标注为Truhlar的具体是来自于哪一篇文献?我用了m06-2x/6-311+g(d,p)的scale factor,想引用这个scale factor来源的参考文献。我看您标注的来源是Truhlar,我就去web of science搜了Truhlar的文章,还去Truhlar课题组的网站搜索了一下,但是都没找到这个方法的scale factor,所以想和您咨询一下来源标注为Truhlar的具体是那一篇文献。麻烦您了!

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发表于 Post on 2022-4-23 16:18:04 | 只看该作者 Only view this author
美泽虎 发表于 2022-4-23 16:04
楼主您好!非常感谢您的分享!有一个问题想和您请教一下。请问在表中来源那块儿标注为Truhlar的具体是来自 ...

又翻了翻官网找到啦!

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发表于 Post on 2022-7-22 13:39:57 | 只看该作者 Only view this author
美泽虎 发表于 2022-4-23 16:18
又翻了翻官网找到啦!

请问你在引用Truhlar的数据时如何加参考文献的?

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发表于 Post on 2022-7-24 19:54:35 | 只看该作者 Only view this author
kenhe 发表于 2022-7-22 13:39
请问你在引用Truhlar的数据时如何加参考文献的?

我当时是去Truhlar课题组的官网考古找到的。你用这个网址进去找找看有没有你用的方法。https://comp.chem.umn.edu/freqscale/index.html

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发表于 Post on 2022-11-6 16:23:29 | 只看该作者 Only view this author
老师,我看这个表格没有多参考的频率校正因子,是多参考方法不需要考虑频率校正吗?

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发表于 Post on 2022-11-6 16:37:04 | 只看该作者 Only view this author
bxpu 发表于 2022-11-6 09:23
老师,我看这个表格没有多参考的频率校正因子,是多参考方法不需要考虑频率校正吗?

因为多参考态方法的校正因子和活性空间大小有关,没办法拟合得到一套对所有体系都适用的校正因子。
当活性空间极其小(例如CAS(2,2))的时候,CASSCF校正因子应该和HF类似,CASPT2/NEVPT2校正因子应该和MP2类似;当活性空间极其大的时候,多参考态方法的校正因子应该和CCSD(T)等很高精度的方法类似。但是没人说得准活性空间多小算小,多大算大。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-11-7 11:07:08 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-6 16:37
因为多参考态方法的校正因子和活性空间大小有关,没办法拟合得到一套对所有体系都适用的校正因子。
当活 ...

我大概明白了,谢谢老师的回答!

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发表于 Post on 2022-11-8 17:17:48 | 只看该作者 Only view this author
楼主老师您好!非常感谢您的分享!有一个一直比较困惑的问题想向您请教一下,我看到您给出的频率校正因子是基频(Fundamentals),在Truhlar的官网上除了基频,还给出了谐振频率(Harmonic Frequencies),我看到sob老师自行拟合校正因子的文章也给出了两种频率校正因子http://sobereva.com/391,我们当前主要进行反应动力学的理论研究,我发现频率校正因子这个地方一直没有统一的用法,有些人用的是基频校正因子,有些用的是谐振频率校正因子,请问这两种频率有什么区别?应该用哪一种更合适呢?

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发表于 Post on 2023-6-11 10:08:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-6-10 12:33
自行拟合基频校正因子与ZPE校正因子的简单方法
http://sobereva.com/391(http://bbs.keinsci.com/threa ...

很好的总结,卢老师建议的这个简单方法也很实用。
请教一个问题:不同泛函和基组之间,这个校正系数,是不是可以作为一个绝对基准将它们统一进行绝对比较?

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