过渡态计算求助（有偿）

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-29 21:45:30

chiweijie 发表于 2016-7-29 20:46
有实验数据吗，或者实验中是否使用了催化剂？

实验数据暂无，是诸多文献中说的，碳基材料对N2O具有还原作用

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-29 22:08:09

chiweijie 发表于 2016-7-29 20:46
有实验数据吗，或者实验中是否使用了催化剂？

诸多文献都有报道碳基可以还原N2O

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 00:33:19

本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-7-30 01:47 编辑

小书童发表于 2016-7-29 16:09
实验表明碳基可以还原N2O成N2，对于这个领域很多文献用的模型就是我的这个。老师我只是问您反映路径怎么 ...

可否提供使用这一模型代替“碳基”来分析反应、并经历有一定相似性的中间体的文献？学习一下。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 00:37:34

小书童发表于 2016-7-29 16:11
这个很多苯环，如果好画，您也就早看出了吧

→_→谁说看不出来，只是说你用多重度为2说明你可能没看出来。我瞎猜这货或许是个三自由基

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 08:38:01

本帖最后由小书童于 2016-7-30 08:43 编辑

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 00:37
→_→谁说看不出来，只是说你用多重度为2说明你可能没看出来。我瞎猜这货或许是个三自由基

那您直接说我的多重度设定不对就行了，键线式我真不会画。三自由基是有三个孤立电子吗？s=3/2，S=2s+1=3+1=4，那自旋多重度是4？

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 08:38:48

本帖最后由小书童于 2016-7-30 08:41 编辑

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 00:33
可否提供使用这一模型代替“碳基”来分析反应、并经历有一定相似性的中间体的文献？学习一下。

当然可以，这类文献很多，我先上传一个，您看看。但我更希望老师对我的这个反应多帮帮忙，确实心里很着急。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 09:21:03

本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-7-30 10:38 编辑

小书童发表于 2016-7-30 08:38
那您直接说我的多重度设定不对就行了，键线式我真不会画。三自由基是有三个孤立电子吗？s=3/2，S=2s+1=3+ ...

不只是多重度，计算前应当首先了解自己的体系，大致要计算的是什么过程、化合物本质上是什么，很多结论在计算之前应该有一些预判，对计算会有很多帮助，例如你的反应物的自旋密度不用计算就知道分别处于右边的两个活性位点和N2上。

同时也不用计算就可以猜测Quartet和Doublet的自旋密度分布大概如下，Quartet的能量应该较低，等。

计算之前应该对自己的体系有分析，而不是拿着结构键线式都画不出来就开始一通算

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 09:26:36

本帖最后由小书童于 2016-7-30 09:45 编辑

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 09:21
不只是多重度，计算前应当首先了解自己的体系，大致要计算的是什么过程、化合物本质上是什么，很多结论在 ...

老师上面的这个图是您手画的，还是软件帮您判断画出来的啊，太神奇了。多谢老师。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 10:35:02

本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-7-30 10:39 编辑

小书童发表于 2016-7-30 09:26
老师上面的这个图是您手画的，还是软件帮您判断画出来的啊，太神奇了。多谢老师。

自己ChemDraw画的。。。类似的问题不会的话基础有机会挂科。。。

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 10:49:16

本帖最后由小书童于 2016-7-30 10:55 编辑

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 10:35
自己ChemDraw画的。。。类似的问题不会的话基础有机会挂科。。。

若是学过化学，就不会问这么LOW的问题了，热动专业的学生，用量化解决本专业的问题，闹笑话了，老师见谅。老师那么按照您的意思我要试试2和4,之前用2算的，算不出来，这次我试试4.还有，若是反应物和产物的自旋多重度都不相同，这个反应可如何计算啊？TS的时候给个什么多重度合适啊？此外，我画圈的地方的C，是不是没有饱和？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 10:57:43

本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-7-30 11:03 编辑

小书童发表于 2016-7-30 10:49
若是学过化学，就不会问这么LOW的问题了，热动专业的学生，用量化解决本专业的问题，闹笑话了，老师见谅 ...

你画这产物和反应物化学式都不一样，要么是Quartet要么是Doublet，你这怎么出来Triplet了。一般的TS，产物和底物的多重度须一样，不然似乎还涉及MECP那一套，十分复杂，我也没玩过，如果产物和底物的基态的多重度不一样确实是个麻烦事。

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 11:18:27

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 10:57
你画这产物和反应物化学式都不一样，要么是Quartet要么是Doublet，你这怎么出来Triplet了。一般的TS，产 ...

没看出来化学式怎么不对了，我就是把O的双键拆开了，让O和N成键了。其他的并没有动。化学式上差了什么，请老师明示，多谢

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 11:20:29

本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-7-30 11:29 编辑

小书童发表于 2016-7-30 10:49
若是学过化学，就不会问这么LOW的问题了，热动专业的学生，用量化解决本专业的问题，闹笑话了，老师见谅 ...

你都少了个氢。。。就是你后来修改的画圈的地方。正确的应该如下图。

之前只看了你的产物，没看反应物。现在看，我猜反应物确实有可能是Doublet稳定，我觉得Doublet的几个共振式可能中间成分较高，不过不确定，可以用NRT之类的确认一下。这样涉及反应物的基态和产物的基态多重度不同（不在一个PES上）。。。麻烦事。不过你可以计算一下在不同多重度下优化的能量，验证一下对不对。

小书童 · 发表于 Post on 2016-7-30 11:29:36

liyuanhe211 发表于 2016-7-30 11:20
你都少了个氢。。。就是你后来修改的画圈的地方。正确的应该如下图。

老师您的图没有上传上来。还有我们经常用的碳基模型的两个模型是这样的，其中一个怎么感觉好怪啊？

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-7-30 11:34:11

小书童发表于 2016-7-30 11:29
老师您的图没有上传上来。还有我们经常用的碳基模型的两个模型是这样的，其中一个怎么感觉好怪啊？

上一贴的图

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