诡异的ORCA运行问题

ikea1984 · 发表于 Post on 2023-6-27 11:08:53

在集群交单节点并行作业，同样的作业同样的作业脚本文件，有时候能正常运行，有时候会死在“ORCA finished by error termination in GTOInt”，系统会报告“ORTE was unable to reliably start one or more daemons.” 集群上各节点配置应该是一样的，算其他程序从来没遇到问题。。。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-27 14:20:32

估计是openmpi安装问题，或者硬件问题

ikea1984 · 发表于 Post on 2023-6-27 16:23:25

本帖最后由 ikea1984 于 2023-6-27 16:39 编辑

wzkchem5 发表于 2023-6-27 14:20
估计是openmpi安装问题，或者硬件问题

我尝试好些不同的openmpi的编译参数，都不太行。而且如果说是openmpi编译的话，应该次次都会错。但是现在是相同的输入、脚本，有可能交上去会死，有可能就能正常算。还有一点是，感觉跟队列中运行了几个orca程序有关，感觉头3个还能算，后面的交上去就会死。。。。

补充：更坑的是，如果我用pbs脚本把节点占住（不然不能登录到后台），到后台计算节点手工提交orca的计算，则非常顺利。。。

flyingchow · 发表于 Post on 2023-6-27 23:31:08

使用apptainer吧。只要不是硬件问题，apptainer是肯定能跑的。

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-6-28 00:08:11

ikea1984 发表于 2023-6-27 09:23
我尝试好些不同的openmpi的编译参数，都不太行。而且如果说是openmpi编译的话，应该次次都会错。但是现在 ...

那恐怕跟PBS提交脚本也有关系，例如PBS脚本没有正确设置某些环境变量

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[ORCA] 诡异的ORCA运行问题