化合物中某一位点的pKa如何计算呢？

CocuLiu · 发表于 Post on 2023-7-8 22:01:01

想问一下大家，像图片中化合物中某一位点的pKa该如何计算呢？不是整个分子的pKa。谢谢大家

wudiazhu · 发表于 Post on 2023-7-8 22:47:42

构造热力学循环算自由能，或定量构效关系（QSAR）方法，之前看的文章里有，https://wires.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/wcms.1218

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-9 04:15:43

pKa本来就是对于位点而言的，分子的质子解离也是从特定位点上解离的

公社论坛首页搜索框搜pKa，相关的计算讨论大把

用Multiwfn基于静电势也可以讨论pKa，看
谈谈怎么计算“原子的静电势”
http://sobereva.com/641（http://bbs.keinsci.com/thread-29998-1-1.html）

更多讨论见我参与的这篇文章
Molecular Acidity-An Accurate Description with Information-Theoretic Approach in Density Functional Reactivity Theory, J. Comput. Chem., 39, 117 (2018) DOI: 10.1002/jcc.25090

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-7-9 16:19:42

https://mattermodeling.stackexch ... -molecule/9482#9482

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