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[Gaussian/gview] Gaussian对Fe(III)长链有机酸配合物结构优化相关问题请教

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本帖最后由 wzm12天空 于 2023-7-13 08:49 编辑

本人在做分子1:硬脂酸铁(Fe(III)(OOC18H35)3)分子2:HFe(II)(OOC18H35)2分子的相关计算。最开始做结构优化时计算级别为PBE0/6-311G* em=gd3bj,两个分子都能收敛。但接下来想计算同分子配体C自由基时对第一个分子相同级别下C1,C2都能正常收敛,C3以后就一直有-0.8左右的虚频,试了sob帖子:http://sobereva.com/278(Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法)中的除calcall(计算非常耗时)的其余方法都无法消除虚频。所以尝试换了6-311G**基组做优化,消除了虚频。由于我下一步要计算单点能,所以就把分子1和2也在6-311G**级别下重新优化。但是出现了问题:分子1可以正常收敛,但是分子2始终无法正常收敛(计算过程中查看log文件发现位移始终里比收敛限高两个数量级),期间试过GDIIS和maxstep=3/5,notrust关键词帮助收敛,由于离收敛太远没有尝试calcall相关关键词。
请教:1. 为什么6-311G*能够收敛,但给H加极化(6-311G**)却不能收敛?有什么比较好的办法帮助收敛吗?
         2. 结构优化用不同的基组(6-311G*和6-311G**),单点用统一基组做计算可行吗?对结果影响大吗?
附件fehst3_opt.gjf和
fehst3_opt.log为正在计算的分子2的相关文件。


分子2:HFe(II)(OOC18H35)2.png (45.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

6-311G*下优化完成的分子1

6-311G*下优化完成的分子1

分子1:Fe(III)(OOC18H35)3.png (67.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

6-311G*下优化完成的分子2

6-311G*下优化完成的分子2

正在优化的分子2的输入文件和log文件.zip

1.91 MB, 下载次数 Times of downloads: 6

6-311G**优化分子的相关文件

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发表于 Post on 2023-7-13 12:39:10 | 只看该作者 Only view this author
1 纯属巧合。只要用恰当的关键词帮助收敛,二者都必定能收敛。能解决问题的关键词绝对不会超过下文所列范畴,反复认真一个字一个字阅读
量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法
http://sobereva.com/164

“离收敛太远没有尝试calcall相关关键词” 这句话完全没有逻辑。怎么会以为离收敛限较远时calcall、recalc就不起作用?

2 原则上不行
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-13 13:05:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-13 12:39
1 纯属巧合。只要用恰当的关键词帮助收敛,二者都必定能收敛。能解决问题的关键词绝对不会超过下文所列范畴 ...

谢谢sob老师
那像图中这样的分子,您给推荐几个有助于收敛的关键词吧,谢谢!

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发表于 Post on 2023-7-13 13:13:20 | 只看该作者 Only view this author
wzm12天空 发表于 2023-7-13 13:05
谢谢sob老师
那像图中这样的分子,您给推荐几个有助于收敛的关键词吧,谢谢!

把结构尽可能摆得满足对称性,让程序判断出点群
之后考虑maxstep=3,notrust,recalc=3
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-13 13:55:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-13 13:13
把结构尽可能摆得满足对称性,让程序判断出点群
之后考虑maxstep=3,notrust,recalc=3

谢谢sob老师,我试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-13 14:42:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzm12天空 于 2023-7-13 14:55 编辑
sobereva 发表于 2023-7-13 12:39
1 纯属巧合。只要用恰当的关键词帮助收敛,二者都必定能收敛。能解决问题的关键词绝对不会超过下文所列范畴 ...

老师,我这个结构优化用PBE0/6-311G**; 单点能计算用PBE0/def2-TZVP级别可以吗?

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发表于 Post on 2023-7-14 10:50:38 | 只看该作者 Only view this author
wzm12天空 发表于 2023-7-13 14:42
老师,我这个结构优化用PBE0/6-311G**; 单点能计算用PBE0/def2-TZVP级别可以吗?

基组可以。
应当带上色散校正。PBE0对色散作用描述很差。考虑色散作用后,很长的烃链会倾向于聚拢
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-14 10:54:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzm12天空 于 2023-7-14 10:59 编辑
sobereva 发表于 2023-7-14 10:50
基组可以。
应当带上色散校正。PBE0对色散作用描述很差。考虑色散作用后,很长的烃链会倾向于聚拢

好的老师,谢谢。另外对于泛函,我查了下ωB97M-V计算能量是比较精确的,但是Gaussian没有内置。请问老师目前来说这个泛函可以通过手动设置参数实现Gaussian计算吗?我用的事G16.C01版本

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发表于 Post on 2023-7-14 11:18:22 | 只看该作者 Only view this author
wzm12天空 发表于 2023-7-14 10:54
好的老师,谢谢。另外对于泛函,我查了下ωB97M-V计算能量是比较精确的,但是Gaussian没有内置。请问老师 ...

没法通过自定义方式使用
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-7-14 11:39:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-7-14 11:18
没法通过自定义方式使用

明白了,谢谢老师的解答

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