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[GAMESS-US] gamess 能量分解 内存不够

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楼主
用gamess算LMOEDA,103个原子,两个金属的体系,monomer的计算可以进行,算到super molecule就内存或DDI出错,是不是这体系太大了啊

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发表于 Post on 2016-8-12 10:42:06 | 只看该作者 Only view this author
体系有点大,用GAMESS来能量分解很吃内存的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-12 10:49:58 | 只看该作者 Only view this author
冰释之川 发表于 2016-8-12 10:42
体系有点大,用GAMESS来能量分解很吃内存的。

Molpro和ADF没钱买,SAPT装不上,PSI4不能用赝势,现在gamess也算不了,有洪荒之力也使不出来了

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发表于 Post on 2016-8-12 10:55:09 | 只看该作者 Only view this author
1) gamess的EDA确实吃内存,我服务器配了256G内存很大程度上就是为了EDA。2)我体系是有机分子,94个原子,blyp/maug-cc-pvtz算不动,6-311++G(d,p)要算3天。3)MWORDS和MEMDDI都要设,后者还得设大一些

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发表于 Post on 2016-8-12 11:04:23 | 只看该作者 Only view this author
很久没用过了。

是不是可以尝试DIRSCF=.T.?

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发表于 Post on 2016-8-12 11:12:34 | 只看该作者 Only view this author
楼主可以贴出输入文件看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-12 13:56:39 | 只看该作者 Only view this author
wei 发表于 2016-8-12 10:55
1) gamess的EDA确实吃内存,我服务器配了256G内存很大程度上就是为了EDA。2)我体系是有机分子,94个原子,b ...

看你这么说我基本上放弃了,我128G的内存,体系还大,用的是未加弥散的triple zeta基组,MWORDS和MEMDDI设的大到不能再大了,然并卵啊~~~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-12 13:57:02 | 只看该作者 Only view this author
yflchx 发表于 2016-8-12 11:04
很久没用过了。

是不是可以尝试DIRSCF=.T.?

这个关键词已经用上了,然并卵。。。

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发表于 Post on 2016-8-12 15:30:14 | 只看该作者 Only view this author
nunup5 发表于 2016-8-12 13:57
这个关键词已经用上了,然并卵。。。

像上百个原子的大体系,内存肯定是硬伤,其它EDA软件需不需要这么大的内存我不知道,但是GAMESS肯定没戏了(如果计算机共享内存很小的话)
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发表于 Post on 2016-8-12 17:57:37 | 只看该作者 Only view this author
如果用的是未加弥散的triple zeta基组,我感觉128G还是可以算动的;ADF我用过,能量分解没有gamess的好

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发表于 Post on 2016-8-13 10:27:45 | 只看该作者 Only view this author
wei 发表于 2016-8-12 10:55
1) gamess的EDA确实吃内存,我服务器配了256G内存很大程度上就是为了EDA。2)我体系是有机分子,94个原子,b ...

老师您好,我想计算一个只有C、H、O的有机分子体系,约90个原子。
新手一枚,提出一些简单疑问,请您见谅!
最近刚学习使用gamess的能量分解,看到您说gamess计算能量分解很费内存,我们实验室的机子是126G的内存,考虑到计算耗时和精度,那么使用blyp/6-311+G(d,p)方法和基组是否可以呢?基组重叠误差和色散校正应该怎么考虑呢?gamess是否支持D3校正呢?谢谢老师。

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发表于 Post on 2016-8-13 13:46:12 | 只看该作者 Only view this author
1) blyp/6-311+G(d,p)方法和基组是否可以呢?-----应该可以
2)基组重叠误差?---输出结果有考虑
3)色散校正?gamess是否支持D3校正呢?-----LMO-EDA,mp2方法可以校正;DFT的D3或D2校正只有GKS-EDA方法支持,这一方法似乎还没纳入gamess的网上版本

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发表于 Post on 2016-8-13 16:42:22 | 只看该作者 Only view this author
wei 发表于 2016-8-13 13:46
1) blyp/6-311+G(d,p)方法和基组是否可以呢?-----应该可以
2)基组重叠误差?---输出结果有考虑
3)色散 ...

非常感谢老师的解答!谢谢老师!

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发表于 Post on 2016-8-14 09:16:31 | 只看该作者 Only view this author
wei 发表于 2016-8-13 13:46
1) blyp/6-311+G(d,p)方法和基组是否可以呢?-----应该可以
2)基组重叠误差?---输出结果有考虑
3)色散 ...

GKS-EDA 可以直接问开发者要修改版的GAMESS
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-8-15 09:59:27 | 只看该作者 Only view this author
dy19930508 发表于 2016-8-13 16:42
非常感谢老师的解答!谢谢老师!

色散校正可以用Grimme的DFTD3程序来计算,安装和计算都不难。

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