求助：审稿人询问计算有机体系有无使用别的泛函验证结论可靠性

Wangying001 · 发表于 Post on 2023-7-29 00:05:23

如题，我在计算某一有机体系中，使用了M062X/6-31g(d,p)进行结构优化，M062X/6-311+g(d,p)计算单点能。审稿人询问我有没有使用别的计算方法验证结论可靠性？我只用了这一个计算方法，且有机体系很大，过渡态较多，我想了如果要补计算的话一个月的时间不太能完成；且b3lyp-d3的表现在有机体系中没有m062x好。。我之前用b3lyp跑不出理想的过渡态数据。
综上，请问我该如何回复？我想在回复意见里补充m062x的优点，引用别人做的benchmark文章来说明可以吗？这样算回避审稿人问题吗？或者还有没有更好的方法回复呢？

Deepast · 发表于 Post on 2023-7-29 02:52:46

不用优化，算个单点就行，不费事

Wangying001 · 发表于 Post on 2023-7-29 11:55:45

Deepast 发表于 2023-7-29 02:52
不用优化，算个单点就行，不费事

只算个单点比较就可以吗？好像和审稿人询问的重点不一样

plus · 发表于 Post on 2023-7-29 12:21:03

验证几个关键数据

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-29 12:33:35

如果只是特征普通的有机反应，给一些benchmark文章就完了，这种文章太多了，M06-2X表现怎么样早有定论（精度好，一般够用，但又达不到wB97M-V那样顶尖），不用再算自己其它级别的数据来对比

Wangying001 · 发表于 Post on 2023-7-29 17:39:19

sobereva 发表于 2023-7-29 12:33
如果只是特征普通的有机反应，给一些benchmark文章就完了，这种文章太多了，M06-2X表现怎么样早有定论（精 ...

Sob老师好！反应体系具有双自由基特征，请问需要计算关键数据验证吗？

sobereva · 发表于 Post on 2023-7-29 19:21:18

Wangying001 发表于 2023-7-29 17:39
Sob老师好！反应体系具有双自由基特征，请问需要计算关键数据验证吗？

你可以用ORCA也算算精度公认理想的wB97M-V，如果结果差不多的话证明M06-2X的数据没问题。如果不会用ORCA的话也可以用Gaussian拿wB97XD作对比。如果体系很小，可以用UCCSD(T)算算（不过这种级别算得动的话用M06-2X就没意义了）

Wangying001 · 发表于 Post on 2023-7-29 19:55:33

sobereva 发表于 2023-7-29 19:21
你可以用ORCA也算算精度公认理想的wB97M-V，如果结果差不多的话证明M06-2X的数据没问题。如果不会用ORCA ...

收到，谢谢sob老师~

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