计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1097|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[MRCC/CFOUR] 通过传真获取CFOUR授权的方法

[复制链接 Copy URL]

63

帖子

1

威望

2058

eV
积分
2141

Level 5 (御坂)

Cfour是一个以做耦合簇见长的从头算程序,使用需要获取开发者的授权。
https://cfour.uni-mainz.de/cfour/index.php?n=Main.Download 中提到 签过名的授权文件([size=14.6667px]license agreement)可以通过普通的邮件寄到德国或者通过传真发送([size=14.6667px]fax number: +49 6131 3923895)。前者略显麻烦,我使用了传真的方法。
  • [size=14.6667px]首先从[size=14.6667px]https://cfour.uni-mainz.de/cfour/index.php?n=Main.MainLicense?action=print下载空白的授权文件,然后打印、签名、扫描为PDF。
  • [size=14.6667px]然后在淘宝上找了个可以发国际传真的商家代发,一共4页,48块钱,可以开发票。

[size=14.6667px]发送日期2023年7月12日,收到开发者的邮件是[size=14.6667px]2023-07-19。一个星期搞定。
[size=14.6667px] 从网站上下载的安装包跟这个帖子里的13楼发的版本一样 [size=14.6667px]http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3018。
[size=14.6667px]安装方式与http://sobereva.com/150帖子里有一些差异,主要是新版本需要用到icpc(c++编译器)以及intel新版本的mkl库里没有libmkl_solver_ilp64.a[size=14.6667px],安装并行版的步骤有2处不同
  • [size=14.6667px]编译mpich2时,./configure FC=ifort 替换成 ./configure FC=ifort CC=icc CXX=icpc
  • 编译cfour时,编译参数换成 FC=ifort CC=icc CXX=icpc MPIFC=mpif90 ./configure --with-blas="$MKLPATH/libmkl_intel_ilp64.a -Wl,--start-group $MKLPATH/libmkl_intel_ilp64.a $MKLPATH/libmkl_intel_thread.a $MKLPATH/libmkl_core.a -Wl,--end-group -qopenmp -lpthread" --enable-mpi=mpich --with-mpirun="mpirun -np \$CFOUR_NUM_CORES" --with-exenodes="mpirun -np \$CFOUR_NUM_CORES" --prefix=/home/nxu/softwares/cfour_mpi

“CFOUR做耦合簇的效率号称很高,CCSD(T)计算对于高对称性体系比Gaussian快2、3倍是有的,结果相符也很好,但是无对称性体系下却并不总比Gaussian09快”。社长这句话一点问题都没有,对于大体系CFOUR可能很慢。此外,在集群上使用,计算目录最好放在slave node的本地硬盘里,使用master的共享硬盘计算速度会打很多折扣。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
sobereva + 5

查看全部评分 View all ratings

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120181

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-8-1 12:10:58 | 只看该作者 Only view this author
游客,本帖隐藏的内容需要积分高于 25 才可浏览,您当前积分为 0
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

201

帖子

0

威望

535

eV
积分
736

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2023-8-1 19:20:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wjc404 于 2023-8-1 19:27 编辑

除了MP2/CCSD/CCSD(T),CFOUR做其他级别的冻芯时的解析导数可能有BUG(比如优化收敛了但是频率任务出来的三个旋转频率明显不为零),不知道现在修复了没有。CCSD的效率与Gaussian相仿。另外算(T)时需要靠MPI才能较好地并行,此时如果不写ABCDTYPE=AOBASIS则磁盘容易爆。

63

帖子

1

威望

2058

eV
积分
2141

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-1 21:53:36 | 只看该作者 Only view this author
感觉比psi4省内存,对于水三聚体,同样CCSD(T)/aug-cc-pVTZ算一阶导数,psi4 256G内存不够用 cfour能算

63

帖子

1

威望

2058

eV
积分
2141

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-2 09:34:33 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2023-8-1 19:20
除了MP2/CCSD/CCSD(T),CFOUR做其他级别的冻芯时的解析导数可能有BUG(比如优化收敛了但是频率任务出来的三 ...

意思就是MKL的那个核心数设为1?

26

帖子

0

威望

318

eV
积分
344

Level 3 能力者

6#
发表于 Post on 2023-9-13 15:21:44 | 只看该作者 Only view this author
急用一个CFOUR2.1版本,请问可以传一个给我吗?后续补上传真。邮箱502771094@@qq.com

21

帖子

0

威望

1271

eV
积分
1292

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2023-9-13 16:40:08 | 只看该作者 Only view this author
chemjay 发表于 2023-9-13 15:21
急用一个CFOUR2.1版本,请问可以传一个给我吗?后续补上传真。邮箱502771094@@qq.com

This might help
https://disk.yandex.ru/d/0BVrB7HEX5O4_w

729

帖子

21

威望

5233

eV
积分
6382

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2023-9-13 18:55:58 | 只看该作者 Only view this author
goldNAN 发表于 2023-8-1 21:53
感觉比psi4省内存,对于水三聚体,同样CCSD(T)/aug-cc-pVTZ算一阶导数,psi4 256G内存不够用 cfour能算

cfour的ccsd(t)比同类程序的效率高太多了(可能只有molpro和e^T的ccsd(t)效率更高一些)。我记得10年前在ccsd(t)/aug-cc-pvtz级别下优化C10H12的结构并计算频率。当时的硬件条件不行,用了全部的几十GB的内存,如果有几百GB,减少读写,效率会更高。其中最耗时的解析频率计算用了40多天,同时提交的数值频率一个月就完成了,应该是解析频率的硬盘读写太多了,导致不如数值频率快。

26

帖子

0

威望

318

eV
积分
344

Level 3 能力者

9#
发表于 Post on 2023-9-14 09:16:24 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 chemjay 于 2023-9-14 09:31 编辑
谢谢

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-17 16:38 , Processed in 0.179678 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list