计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 599|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molclus] 调用Gaussian+ORCA的任务中备份out文件的设置问题

[复制链接 Copy URL]

8

帖子

0

威望

1872

eV
积分
1880

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 he_yixin 于 2023-8-24 23:19 编辑

请问Molclus的settings中 ibkout= 1  // When backup output file. 0: Never, 1: All, 2: Successful tasks, 3: Failed tasks, -1: If backup file exists, directly loading rather than calculating (only available for Gaussian and ORCA) 可以同时启用1和-1吗?

我是用Molclus调用Gaussian进行优化,再用ORCA算单点,但有时候优化的结构有虚频需要手动再优化一下。此时ibkout选择-1,能够读取出已经算好的所有优化out文件(手动算的已正确命名),但由于当前目录存在template_SP.inp,所有单点任务又会被重新计算且不备份。我希望在第二次运行Molclus的时候,能够读取之前ORCA算好的单点out文件,只计算手动优化的那几个的单点并备份out文件,然后再通过isostat基于高精度自由能进行筛选排序,可以实现吗?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112486

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-8-23 07:49:28 | 只看该作者 Only view this author
Molclus官网(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)上更新了1.12版,ibkout=-1也有了=1的效果:
2023-Aug-23:1.12版发布
• ibkout=-1也同时有了ibkout=1的效果。即ibkout=-1时如果有输出文件是被新算出来的,也会被备份

至于你说的“由于当前目录存在template_SP.inp,所有单点任务又会被重新计算且不备份”,在之前1.11版就没这个问题了
2023-Aug-17:1.11版发布
• 改进了settings.ini里ibkout=-1时的处理:对于且当前目录下有template_SP.inp或template_SP.gjf而自动调用ORCA或Gaussian自动算单点时,如果发现当前目录下有以前备份好的相应文件(如orcaSP00002.out、gauSP00005.out),则Molclus会直接读里面的数据而不会重新计算。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

8

帖子

0

威望

1872

eV
积分
1880

Level 5 (御坂)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-8-24 23:18:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-8-23 07:49
Molclus官网(http://www.keinsci.com/research/molclus.html)上更新了1.12版,ibkout=-1也有了=1的效果: ...

感谢社长的迅速更新,我之前用的1.10版,已用1.12版正常运行

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 19:34 , Processed in 4.611888 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list