计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 330|回复 Reply: 0
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 溶剂模型下羟胺邻磺酸与阴离子A-间的两个离子优化出现问题

[复制链接 Copy URL]

121

帖子

0

威望

911

eV
积分
1032

Level 4 (黑子)

各位老师好!

我的问题如下:

在水中,采用羟胺邻磺酸(HOSA)对阴离子A-进行胺化机理研究,我采用的是隐式模型SMD=H2O,计算水平为 Ub3lyp/6-311+g* scrf=(smd,solvent=water) em=gd3。我进行了①HOSA与A-的OPT,②
NH2OSO3-(HOSA水解)与A-的OPT,③ NH2(自由基)与A-的OPT,④NH2+与A-的OPT,结果分别如下图。


图一是①与③的结果,总是氢原子接近A-
图二是②的结果,结果报错了
图三是④的结果,NH2+与A-进行了成键

首先,在进行胺化机理的过程中,我是想进行过渡态计算,但是图一的结果,我总感觉是错的,因为H原子接近A-,感觉更像是H原子会进行氢转移(我也想知道这是为啥会这样)。此外,由于在实验中,需要在溶剂中加入碱性物质提供一个中性(偏碱性的环境),现在我总感觉是不是不应该采用H2O的隐式模型(加入碱可能是为了让HOSA水解),并且是不是②的思路就是错的,不能用两个阴离子进行结构优化。
以上便是我现在的问题,请各位老师批评指正,当然能给些思路或者建议更好,谢谢各位老师!

202308310956069561..png (16.77 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

图三

图三

202308310955419727..png (128.55 KB, 下载次数 Times of downloads: 3)

图二

图二

202308310954234683..png (19.67 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

图一

图一

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 18:37 , Processed in 2.313403 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list