Amber运行pmemd.cuda报错

boinboinxu · 发表于 Post on 2023-9-8 17:29:00

在tleap准备好*.prmtop文件和*.inpcrd文件之后，输入命令为:
export CUDA_VISIBLE_DEVICES=0 pmemd.cuda -O -i 01_Min.in -o 01_Min.out -p RSDTL09_sol.prmtop -c RSDTL09_sol.inpcrd -ref RSDTL09_sol.inpcrd -x 01_Min.mdcrd -inf 01_Min.info -r 01_Min.rst
然后就出现了cudaMemcpyToSymbol: SetSim copy to cSim failed invalid device symbol，请问有人知道是为什么吗？

boinboinxu · 发表于 Post on 2024-3-5 10:15:45

已解决，是显卡3090与Amber18的GPU加速版不兼容

HJP · 发表于 Post on 2024-7-6 09:35:37

boinboinxu 发表于 2024-3-5 10:15
已解决，是显卡3090与Amber18的GPU加速版不兼容

您好，请问您是怎么解决的啊

yantang · 发表于 Post on 2024-11-6 19:39:23

老师您好，我也遇到了一样的问题，请问如何解决呢

hangmint · 发表于 Post on 2024-11-7 14:47:42

yantang 发表于 2024-11-6 19:39
老师您好，我也遇到了一样的问题，请问如何解决呢

重新编译一下，装一个最新的，amber现在学术免费了吧

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[Amber] Amber运行pmemd.cuda报错