[Amber] 什么体系都跑到一个点上

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发表于 Post on 2016-8-30 19:35:45 | 只看该作者 Only view this author 回帖奖励

真郁闷，不管是跑水盒子还是跑Amber官网的例子，所有的水分子都跑到一个点上去了，所有原子的坐标都跑到0附近

附件是我的输入输出和结构，其中min.inpcrd 和 runmd.inpcrd 就是我对应的rst文件，个人习惯改成了inpcrd，能帮帮我看一下吗

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no.prmtop (177.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

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runmd.inpcrd (78.02 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

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WATER.pdb (210 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 4)

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