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[CP2K] 使用cp2k计算小分子在MOF上的结合能应该用什么基组泛函?

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楼主
老师们好,目前我想用cp2k对水分子在MOF(含Zr、C、H、O元素)上的结合能进行计算。

我首先使用PBE/DZVP-MOLOPT-SR-GTH结合dftd3对几何结构进行优化(真空下优化),几何优化顺利结束后使用相同设置对能量进行了计算(计算能量时都使用了SCCS溶剂),分别计算了E(MOF)、E(MOF+水)、E(水), 但是由这几个数据做差得到的结合能高达2000kJ/mol,显然过大,而且与他人的结果(~10kcal/mol)相差甚远。因此想请教各位老师,在cp2k中,这样的计算用什么级别的泛函基组是比较合适的?

谢谢!

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发表于 Post on 2023-9-12 21:27:33 | 只看该作者 Only view this author
当前计算级别没问题,检查其它因素,诸如SCF收敛、溶剂模型设置等。算单点用>=TZVP-MOLOPT-GTH明显更好
并且用SCCS之前先计算一下真空下的结合能,从数量级上判断合理性
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-12 22:35:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-12 21:27
当前计算级别没问题,检查其它因素,诸如SCF收敛、溶剂模型设置等。算单点用>=TZVP-MOLOPT-GTH明显更好
并 ...

明白了,感谢老师指点!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-16 10:50:02 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Alset 于 2023-9-18 10:16 编辑
sobereva 发表于 2023-9-12 21:27
当前计算级别没问题,检查其它因素,诸如SCF收敛、溶剂模型设置等。算单点用>=TZVP-MOLOPT-GTH明显更好
并 ...

老师您好,我在真空下计算了mof和单个水分子的能量,发现这些能量甚至低于在溶剂环境下计算的结果,且溶环境下单点输出极化能为正。同时,真空下的吸附能在-10kcal/mol左右,为合理数量级。因此先前计算很可能是SCCS出了问题,但是我先前在计算NMR时采用了相同的设置(来自multiwfn默认),得到了与实验吻合的NMR结果,因此想请教您在设置上有什么需要注意和修改的地方?

我将输入输出文件贴在下方,烦请您有时间时查看,谢谢!


mof-ene1.inp

30.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 34

mof单点计算的输入文件-更新

mof-ene1.out

62.68 KB, 下载次数 Times of downloads: 11

wt-ene.inp

3.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 10

一个水分子单点计算的输入文件

wt-ene.out

50.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

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发表于 Post on 2023-9-18 09:02:19 | 只看该作者 Only view this author
Alset 发表于 2023-9-16 10:50
老师您好,我在真空下计算了mof和单个水分子的能量,发现这些能量甚至低于在溶剂环境下计算的结果,且溶 ...

mof-ene.out没看到极化能为正
  SCCS| Polarisation energy                  [Hartree]         -0.11389542964344
  SCCS|                                      [kcal/mol]                  -71.470
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-18 10:16:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-18 09:02
mof-ene.out没看到极化能为正
  SCCS| Polarisation energy                  [Hartree]         -0.113 ...

很抱歉,我上传错了文件,现在已经更新了出现正极化能的输出文件

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发表于 Post on 2023-9-18 10:24:55 | 只看该作者 Only view this author
Alset 发表于 2023-9-18 10:16
很抱歉,我上传错了文件,现在已经更新了出现正极化能的输出文件

尝试其它基组
此体系没必要开smearing
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sobereva 发表于 2023-9-18 10:24
尝试其它基组
此体系没必要开smearing

好的,感谢老师的指点

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