计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1277|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 计算两种溶剂混合后的相互作用能过程求助

[复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

85

eV
积分
90

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师,大家好,我想请教一个问题。我想要计算两种溶剂按不同比例混合后它们之间的弱相互作用,比如水和乙醇,我需要计算的是电子能量层面的结合能,还是计算热力学层面的呢?

如果是电子能量层面,那需要考虑溶剂效应吗?已拜读过sob老师的“谈谈BSSE校正与Gaussian对它的处理”这一文,其中提到“溶剂模型下考虑BSSE问题一般做法是在气相下做counterpoise计算得到E_BSSE,然后加到溶剂模型下以常规方式E(AB)-E(A)-E(B)计算的相互作用能上。”这里的以常规方式计算的相互作用能是指使用溶剂模型下的电子能量计算吗?其中单体结构的能量是从优化后的复合物中提取出来计算得到的吗?



比较两种溶剂按不同比例混合后它们之间的弱相互作用,需要保证每一个比例下分子总数相同吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-9-22 03:29:24 | 只看该作者 Only view this author
用哪种取决于实际的研究目的,别人没法告诉你

溶剂效应当然得考虑,对分子间相互作用能影响甚巨,特别是对于极性分子之间。

单独优化各个单体再算能量。你当前的情况算考虑了单体变形能的结合能比算相互作用能更有实际意义

如果你用二聚体模型算结合能,跟比例没直接关系,比例顶多只影响自定义混合溶剂的时候用的参数
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

5

帖子

0

威望

85

eV
积分
90

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-22 10:10:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-22 03:29
用哪种取决于实际的研究目的,别人没法告诉你

溶剂效应当然得考虑,对分子间相互作用能影响甚巨,特别是 ...

老师,意思是我要计算不同比例的两种溶剂混合后的结合能,如果是使用二聚体的模型,那不同比例的结合能差异只体现在自定义混合溶剂参数不同上吗?那是不是复合物优化的时候也需要考虑溶剂效应?

还是我需要得到不同比例下的结合能使用多聚体模型会比较好呢?(按照比例设置不同的单体个数)

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125197

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2023-9-23 05:22:26 | 只看该作者 Only view this author
Hooray818 发表于 2023-9-22 10:10
老师,意思是我要计算不同比例的两种溶剂混合后的结合能,如果是使用二聚体的模型,那不同比例的结合能差 ...



浓度的比例是宏观问题,用复合物模型算单体间相互作用能是微观问题,完全两码事,浓度的比例效应显然不可能靠多聚体模型里单体数目比例来直接体现
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-26 17:43 , Processed in 0.161021 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list