计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 4648|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 高斯几何优化出现Error: segmentation violation报错问题请教

[复制链接 Copy URL]

78

帖子

0

威望

435

eV
积分
513

Level 4 (黑子)

各位老师好,
  在优化一个分子结构是直接报这个错误。同样的关键词换个分子没有问题,第一次遇到这个问题不知如何更改。报错内容如下:

查过报错原因后,看到有说:任何“解决segmentation violation”/“解决2070错误”的方案、解释都可无视并鄙视之。应当看输出文件中的具体错误解决。
于是用文本编辑器打开输出.log文件,拖到最后最终报错如下:

想请教各位老师原因,该如何解决,非常感谢!

103

帖子

0

威望

607

eV
积分
710

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2023-10-25 16:14:11 | 只看该作者 Only view this author
从log文件来看应该是建立内坐标键角和二面角的原子在优化中成一直线了,设置笛卡尔坐标可以从源头上避免这个问题,或者把优化的最后一帧结构取出来重新计算,Gaussian会自动对接近一直线的原子做处理,也可以手动设置直线键。
原子成一直线导致报错比较常见,论坛里有无数类似的问题,具体的解决也有很多人说过了,稍微搜索一下就知道要怎么做了。

78

帖子

0

威望

435

eV
积分
513

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-25 17:59:23 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢您的解答!设置笛卡尔坐标是不是将关键词中的opt改为opt=cartesian就好了呀,是不是也可以在高斯里给分子重新改一改构型再试试。谢谢您!

34

帖子

0

威望

1065

eV
积分
1099

Level 4 (黑子)

4#
发表于 Post on 2023-10-25 20:55:43 | 只看该作者 Only view this author
袁沁琳 发表于 2023-10-25 17:59
非常感谢您的解答!设置笛卡尔坐标是不是将关键词中的opt改为opt=cartesian就好了呀,是不是也可以在高斯里 ...

log文件提示了:32-31-35三个原子呈直线了,你打开量一下,这个叫应该是180°。所以你微调一下结构这三个原子的键角,让它不等于180,再去算

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112440

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2023-10-26 08:40:27 | 只看该作者 Only view this author
老生常谈的问题。以后提问之前先把报错放到论坛首页全文搜索框里搜

看北京科音初级量子化学培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KEQC_content.html)的ppt:
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

78

帖子

0

威望

435

eV
积分
513

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-10-27 09:11:59 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢各位老师的解答,问题已解决。谢谢!!!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-26 07:35 , Processed in 0.196631 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list