计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 676|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 请问CP2K中分别输出价电子密度和原子实,原子实电荷为0

[复制链接 Copy URL]

48

帖子

0

威望

458

eV
积分
506

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我的是 纯水体系,泛函revPBE,基组TZV2P-GTH,赝势GTH-PBE-qX。这里的"价电子"的定义是,每个水分子的两个成键电子对、O上的孤对电子共八个。
CP2K中可以在DFT模块中TOT_DENSITY_CUBE 输出全电子+核的电荷密度,纯粹的价电子密度应该是E_DENSITY_CUBE,
然而我的inp这样写之后:
  1. &PRINT
  2.   &E_DENSITY_CUBE
  3.   FILENAME = density.dat
  4.   STRIDE 1
  5.   &END E_DENSITY_CUBE
  6.      &END PRINT
复制代码


输出的的文件中,读取所有格点后进行运算后,确实是平均每个水分子分到-8|e|,
但是,按照sob老师在http://sobereva.com/125 中所言 第二列应该是是原子实的电荷, 但是我的文件中原子实的部分全都是0 请问这是怎么回事?

  1. -Quickstep-
  2. ELECTRON DENSITY
  3.   192    0.000000    0.000000    0.000000
  4.   150    0.156434    0.000000    0.000000
  5.   150    0.000000    0.156434    0.000000
  6.   150    0.000000    0.000000    0.156434
  7.     8    0.000000   -6.270898   10.019415   10.675371
  8.     1    0.000000   -6.949351   10.874765  -11.271695
  9.     1    0.000000   -7.384103   10.539591    9.225827
  10.     8    0.000000    5.299113    3.775028    0.705205
  11.     1    0.000000    3.699462    3.701815    1.575235
复制代码


5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112393

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2023-11-1 16:08:45 | 只看该作者 Only view this author
不用管那个,不影响你分析电子密度。非要说的话算是CP2K产生的cube文件不规矩
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 18:30 , Processed in 0.148815 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list