求助簇模型补氢优化的问题

pet

sobereva 发表于 2023-11-15 08:10
6-311G*就够了
负电荷在C60上摊得很平均，并不集中分布在某个局部区域

谢谢sob老师，还想咨询一下，我的目的是证明阴离子吸附比中性吸附更有利，现在分别优化出了两种情况下的吸附结构，做柔性扫描也确实发现阴离子吸附的能垒更低，但是两种情况得到的吸附构型不一样，实验上是先用阴离子进攻，最终得到中性材料，但是我在阴离子条件下优化到的吸附结构，拿掉两个电子变成中性直接优化就会又不吸附了，，，这样是不是还是无法证明阴离子吸附更有利呢？  请问理论上应该怎么考虑从阴离子变成中性的过程呢？

sobereva

pet 发表于 2023-11-16 11:46
谢谢sob老师，还想咨询一下，我的目的是证明阴离子吸附比中性吸附更有利，现在分别优化出了两种情况下的 ...

中性时候“不吸附”，阴离子时候吸附，显然就已经证明了
实际上中性不至于完全不吸附，哪怕不考虑静电/共价作用，就光算靠色散吸引作用也注定会吸附，只不过是什么样的吸附的问题而已

pet

sobereva 发表于 2023-11-17 01:09
中性时候“不吸附”，阴离子时候吸附，显然就已经证明了
实际上中性不至于完全不吸附，哪怕不考虑静电/ ...

不好意思sob老师，应该是我没表达清楚。实验上进行了两组对比试验，分别用中性分子进攻和阴离子进攻，反应是在溶液里，但是最终的材料是粉末状的，在粉末材料中确定了该共价键的存在。所以，我理解的是，理论上要做到两点：
1. 证明阴离子要比中性分子更容易与材料结合（指共价作用），表现为反应势垒的降低；
2. 阴离子下生成的共价键到中性条件也必须得存在（因为最终材料是中性的）。
我现在完成了第一步，但是第二步无法证明，因为我阴离子下优化的结构，到中性条件下共价键就断开了。（第1步中优化出来的阴离子和中性条件下的成键结构不一样，中性下成了两根键，阴离子是一根键）。所以想知道在阴离子变成中性的过程中，一定是自由弛豫过去的嘛？有没有可能在这个电子交换过程中，发生一些结构上的变化呢？

sobereva

pet 发表于 2023-11-17 11:12
不好意思sob老师，应该是我没表达清楚。实验上进行了两组对比试验，分别用中性分子进攻和阴离子进攻，反 ...

没有体系细节、具体模型，我不好判断
考虑一下把那个键冻住，做限制性优化，之后再把键放开进一步优化试试。
并且仔细考虑当前模型和实际状态是否有可比性，是否忽略了外环境差异等。当然也可能是有不同机理，不是当前计算模型能直接反映的