chatGPT辅助生成molclus懒人脚本：一键完成对复杂天然产物NMR和ECD计算

欢乐多

Duoo 发表于 2024-10-18 23:12
请问TJ老师,这个流程的第三步,优化结构似乎没有带溶剂么?但是溶剂对于结构优化不是也影响挺大的么?如果我们 ...

您好，
如果优化需要带溶剂可以加上相应溶剂；
溶剂是否影响很大，这要看具体的分子结构，有些分子加上溶剂优化后的变化不是很大，有些很大；我的经验，溶剂没有初始构象的影响大，初始构象是关键，因此构象搜索更加重要；
Gaussian的计算速度是需要设置运行的核数，有两种途径，加入到关键词或改变Gaussian的default设置；
你们计算节点我也不是很了解，我之前用的是，一个节点中有几百核可用，如果用户太多，有些任务会暂停；一个节点任务太多，提交任务可换其他节点。
谢谢