varecof计算VRC-VTST反应速率软件安装教程

junyang · 发表于 Post on 2023-12-4 21:03:13

1、首先在该网站下载软件，Home of the PAPR suite of chemical kinetics codes (anl.gov)

2、打开meta.yaml文件查看依赖 - {{ compiler('c') }} - {{ compiler('cxx') }} - {{ compiler('mpicxx') }} - mpi - blas - openblas # [linux] - slatec

3、openmpi我是用的是4.1。编译器是gcc 以及g++。

4、安装blas。 sudo apt-get install libblas-dev checkinstall
5、安装openblas。sudo apt-get install openblas checkinstall
6、安装slatec。 conda install -c auto-mech slatec

7.编译安装 bash build.sh 即可完成最后安装

flybird52888 · 发表于 Post on 2024-4-19 10:40:31

楼主，请问第二步和第七步的文件咋得到的？2016和2017版本里解压后都没有这俩文件

junyang · 发表于 Post on 2024-5-28 15:26:08

本帖最后由 junyang 于 2024-5-28 15:31 编辑

flybird52888 发表于 2024-4-19 10:40
楼主，请问第二步和第七步的文件咋得到的？2016和2017版本里解压后都没有这俩文件

GitHub - Auto-Mech/VaReCoF: Performs sampling and flux calculations for use in variable reaction-coordinate transition state theory (VRC-TST)，去github上下载

WMlin · 发表于 Post on 2024-6-2 17:15:13

楼主你好，请问VaReCoF的运行命令是什么？我最近在学习这个软件，但是在官网上找不到多余的资料。

WMlin · 发表于 Post on 2024-7-7 15:55:01

WMlin 发表于 2024-6-2 17:15
楼主你好，请问VaReCoF的运行命令是什么？我最近在学习这个软件，但是在官网上找不到多余的资料。

你好，请问您现在知道运行命令了吗，我也是找不到教程和资料

agoni · 发表于 Post on 2024-7-11 21:38:49

WMlin 发表于 2024-6-2 17:15
楼主你好，请问VaReCoF的运行命令是什么？我最近在学习这个软件，但是在官网上找不到多余的资料。

请问您知道怎么运行了吗，我也是刚接触这个软件，如果您方便的话我想和您交流交流

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