求助VENUS安装

liurui · 发表于 Post on 2023-12-9 22:10:44

本帖最后由 liurui 于 2023-12-11 13:22 编辑

各位老师，学生想要计算特殊的反应过程，漫游，查阅文献还有之前的审稿人有在上一篇文章中提建议让算post-ts，查阅这个需要用VENUS来进行计算，所以给开发者的学生发了邮件，非常开心给了安装包，但是学生发现这个软件竟然是Fortran编译的，学生不熟悉Fortran语言，我查阅linux执行.f文件，需要先输入gfortran venus96c1.f ；再输入./a.out；但是发现linux页面现在卡住了，不知道是不是报错了，请各位老师帮学生瞅瞅哪里出问题了，非常感谢！谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-10 07:42:24

这是运行方式问题，先去看手册弄清楚怎么运行的，很可能程序需要以重定向方式把输入文件内容传递给程序，直接这么进入就会一直傻等着，跟Gaussian的情况类似

注：看17#我的回复了解到底有没有必要使用这个极小众程序

18392667184 · 发表于 Post on 2023-12-11 09:53:38

兄弟你安装好了能不能顺手写个安装教程我也想装一下不会装

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 10:00:22

18392667184 发表于 2023-12-11 09:53
兄弟你安装好了能不能顺手写个安装教程我也想装一下不会装

兄弟，呜呜呜，俺也不会，正在挣扎，说明书完全看不懂

太难了，要是整出来，俺肯定写，哎

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 10:01:23

sobereva 发表于 2023-12-10 07:42
这是运行方式问题，先去看手册弄清楚怎么运行的，很可能程序需要以重定向方式把输入文件内容传递给程序，直 ...

谢谢老师，俺再仔细读一下说明书，非常感谢！

Santz · 发表于 Post on 2023-12-11 10:17:50

liurui 发表于 2023-12-11 10:01
谢谢老师，俺再仔细读一下说明书，非常感谢！

或许你可以把软件包传上来让大家可以帮忙试试。

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 10:29:10

Santz 发表于 2023-12-11 10:17
或许你可以把软件包传上来让大家可以帮忙试试。

老师，在这里下载的，不太好直接搬运其他老师的文件

，谢谢老师，非常感谢！
http://bbs.keinsci.com/thread-26383-1-1.html

yflchx · 发表于 Post on 2023-12-11 10:29:44

如果想快速解决问题，直接用Gaussian里面的BOMD也可以实现，VENUS可以慢慢学。

印象中论坛里有人发过Singleton组里的一个程序，也可以尝试用。

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 10:30:39

Santz 发表于 2023-12-11 10:17
或许你可以把软件包传上来让大家可以帮忙试试。

VENUS老师的学生给的和这位老师中给的一样的，谢谢老师非常感谢！

18392667184 · 发表于 Post on 2023-12-11 10:42:03

Santz 发表于 2023-12-11 10:17
或许你可以把软件包传上来让大家可以帮忙试试。

我这有包

venus96.rar (1.15 MB, 下载次数 Times of downloads: 31)

Santz · 发表于 Post on 2023-12-11 12:05:01

liurui 发表于 2023-12-11 10:29
老师，在这里下载的，不太好直接搬运其他老师的文件，谢谢老师，非常感谢！
http://bbs.keinsci.com/ ...

你不愿意上传那就没法了，事实上这个网址的安装包与你的截图中显示的并非一致。

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 13:23:07

Santz 发表于 2023-12-11 12:05
你不愿意上传那就没法了，事实上这个网址的安装包与你的截图中显示的并非一致。

老师，刚刚看到，上传了，请您过目，谢谢老师，非常感谢！

Santz · 发表于 Post on 2023-12-11 15:03:08

本帖最后由 Santz 于 2023-12-12 20:00 编辑

这个编译方式让人实在难受，手边暂时没有合适的机器，只能在云服务器上简测了下。此软件竟然还在用F77。
系统环境：CentOS Linux release 7.9.2009 + GNU-4.8.5，gfortran版本为GNU Fortran (GCC) 4.8.5 20150623 (Red Hat 4.8.5-44)
测试文件：h2o.dt5 al3.dt5，来源于这里的安装包的datafiles

以下方式仅供参考，软件作者应该有完美方法。
方式一：gfortran编译器编译，这里采用的是自带的GNU Fortran (GCC) 4.8.5

gfortran --version
tar -xvf venus96c1.tar
vim Makefile
#修改Makefile第六行FC = g77为FC = gfortran -std=legacy
make
#测试
./venus96C.e < h2o.dt5 > h2o.out
./venus96C.e < al3.dt5 > al3.out

复制代码

方式二：Intel Fortran编译器，不用它的Makefile，这里使用的是ifort-19.0.5

source ~/scripts/intel-19.0.5.sh
ifort --version
tar -xvf venus96c1.tar
ifort -o venusexec venus96c1.f
#测试
./venusexec < h2o.dt5 > h2o.out
./venusexec < al3.dt5 > al3.out

复制代码

可能存在的bug：会产生一堆fort.文件

Santz · 发表于 Post on 2023-12-11 15:04:07

Santz 发表于 2023-12-11 15:03
这个编译方式让人实在难受，手边暂时没有合适的机器，只能在云服务器上简测了下。此软件竟然还在用F77&#128 ...

@liurui @18392667184

liurui · 发表于 Post on 2023-12-11 15:17:12

Santz 发表于 2023-12-11 15:04
@liurui @18392667184

哇哦，谢谢老师，俺马上去试试呜呜呜，谢谢老师，非常感谢！！！！

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