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[综合交流] 有哪些量化软件比较适合计算多肽小分子的光谱图?

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想请教大家一个问题,我利用MD的方法跑一个  小分子的多肽,得到1000个初始的构型,我参考http://sobereva.com/165,这个帖子得到较为稳定的初始构型。
我的问题是 : 使用哪些量化软件可以很方便的计算  该物质的 红外,拉曼,UV-Vis, ECD 和 VCD 光谱图?(PS:VASP 是否适合进行这类的计算)

Sob老师的http://sobereva.com/224 帖子中指出了如何使用 Multiwfn 根据计算结果绘制光谱图,不知道是否可以输出  二维的光谱图数据?

谢谢大家的回复!






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发表于 Post on 2016-10-11 01:25:21 | 只看该作者 Only view this author
VASP派不上用场。Gaussian+Multiwfn就能很容易计算和绘制
不知道你说的二维光谱图数据具体指什么
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-11 08:16:28 | 只看该作者 Only view this author
感谢Sob老师的回复,我所谓的二维光谱图类似于这种形式:参考这篇文献

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发表于 Post on 2016-10-11 13:19:19 | 只看该作者 Only view this author
ruanyang 发表于 2016-10-11 08:16
感谢Sob老师的回复,我所谓的二维光谱图类似于这种形式:参考这篇文献

看样子得用专用程序或者自己写,现成的量化上用的光谱绘制工具都做不到
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-11 13:35:03 | 只看该作者 Only view this author
恩恩,多谢Sob老师的回复!

还有一个问题就是直接利用:  高斯计算分子的振动频率,在根据输出结果编程处理是否可行?

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发表于 Post on 2016-10-11 16:54:21 | 只看该作者 Only view this author
ruanyang 发表于 2016-10-11 13:35
恩恩,多谢Sob老师的回复!

还有一个问题就是直接利用:  高斯计算分子的振动频率,在根据输出结果编程 ...

我没仔细看你的那种光谱图的原理是怎么弄的,如果需要利用各个结构下的正则频率数据,从高斯输出文件中提取是可以的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-10-11 18:26:19 | 只看该作者 Only view this author
理解了Sob老师,感谢您的回复!

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