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[CP2K] cp2k精度设置以及加弥散后“Cholesky decompose failed”错误求助

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本帖最后由 hhhhhhhhh 于 2024-1-23 15:13 编辑

各位老师好!我计算的目标是针对周期性系统和非周期性系统,分别使用cp2k和Gaussian进行dft计算得到能量和受力,并使得这两者的计算结果在相同的理论水平(或者说具有可比性)。Gaussian中计算设置的关键词是“ub3lyp/6-311+g(d,p) em=GD3BJ  guess=read nosymm force scf=noincore”,由于使用Gaussian计算周期性结构无法加色散,以及已经使用Gaussian计算并得到了大量结果不方便更改计算软件,因此想要利用cp2k进行周期性体系的计算,对此我有以下几个问题
1. 如何在cp2k里面对dft的积分格点进行设置,使得cp2k计算的能量和受力的结果具有和Gaussian计算结果的可比性?
2. 在阅读了社长的博文后:CP2K做杂化泛函计算的关键要点和简单例子 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com),计划先做“blyp-d3(bj)/6-311+G**”的计算得到wfn文件,再做“b3lyp-d3(bj)/6-311+G**”的计算得到最后的结果,但是我在cp2k中设置的泛函和基组为“blyp/6-311+G**”,就会出现 “Cholesky decompose failed: the matrix is not positive definite or ill-conditioned”错误,而相同的结构我在不加弥散时,不管是blyp或是b3lyp都能计算且scf最后收敛,我尝试加大结构和更换基组为6-311++G**(6-311+G**的参数是我自己加进去的),仍然出现相同的错误,请问各位老师,这个错误应该如何解决呢?附件给出了我使用的“6-311+G**”基组参数,我把这些参数添加到文件EMSL_BASIS_SETS中去了。
3. 我计算的结构是石墨烯,一般说来,在计算的时候应该开启smearing,但是我发现在开启smearing时,耗时很长,且有很有可能scf不收敛,即使此时已经读取纯泛函的wfn文件,而开启ot计算却能节省大量时间,因此我的问题是由于我只需要结构的能量和受力,能否直接使用ot的计算结果?附件给出了分别使用smearing和ot计算的out文件,由于弥散的问题我还没有解决,因此计算的泛函和基组为“b3lyp(d3bj)/6-311G**”,开启smearing计算时读取的wfn文件是ot计算得到的(直接读纯泛函的wfn文件时scf不收敛)。

cp2k.zip

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发表于 Post on 2024-1-23 19:35:17 | 只看该作者 Only view this author
1 CUTOFF越大积分格点越精细,还可以&DFT / &XC / &XC_GRID里写USE_FINER_GRID T使用更精细的格点(四倍的CUTOFF)算交换-相关泛函部分。这只是影响可比性的一部分,参考北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里的讲解:






2 计算凝聚态周期性体系绝对不要用常规的带弥散函数的基组,这是常识知识,否则线性相关问题会非常厉害。必须要弥散函数就用MOLOPT系列基组,带了指数很小的高斯函数(尤其是不带SR的版本),而由于它是广义收缩又不至于出现线性依赖问题导致数值不稳定性。这点我之前在论坛里说过多遍

3 smearing并不会影响每一轮SCF的耗时。算导体体系不开smearing通常明显更难收敛。石墨烯开smearing时SCF收敛不了一定是自己使用不当,没必要试图靠切换成OT来回避。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-23 20:23:50 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hhhhhhhhh 于 2024-1-23 20:47 编辑
sobereva 发表于 2024-1-23 19:35
1 CUTOFF越大积分格点越精细,还可以&DFT / &XC / &XC_GRID里写USE_FINER_GRID T使用更精细的格点(四倍的C ...

好的,谢谢社长的解答。

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