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[综合交流] 求助找不到已知单重态过渡态的三重态结构

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本帖最后由 w179152696 于 2024-1-31 10:26 编辑

      各位老师,最近我在做一些单分子的异构反应。其中有一个甲基从氮位点异构到氧位点的反应。在单重态下采用guess=mix,M06-2X/6-311++G(d,p)获得了过渡态的结构和频率,随后在CCSD(T)F-12/VTZ-F12下计算了单点能,发现过渡态具有很强的多参考态性质,T1诊断0.41多。因此想用文献中报道的方法,先计算多参考态性质更小的三重态结构和能量,然后减去多参考态方法计算T-S gap,得到修正后的反应能垒。但是试了非常多方法,一直在找不到三重态下的过渡态。。方法包括,直接用单重态过渡态做初猜,重新优化三重态反应物和产物做QST2,ORAC的NEB-TS,以及对O-CH3距离进行柔性扫描找能量最高点。在三重态下总是会得到一些奇怪的结果,比如甲基上的H原子分离,通过IRC计算发现均不是异构反应的过渡态。
      之前利用CASSCF做过渡态搜索也没有找到过渡态,不知道是什么情况,请各位老师给一些指导和建议。单重态的结构优化和单点能计算结果均附于附件中。

opt_freq_gauss.log

448.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

结构优化

sp_molpro.out

39.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

单点能

triplet_uccsd(t).out

41.8 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2024-1-29 16:28:21 | 只看该作者 Only view this author
这种“修正”方法本身可能并不合理。如过渡态应该是单重态,直接算单重态就行了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-29 17:06:17 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-1-29 16:28
这种“修正”方法本身可能并不合理。如过渡态应该是单重态,直接算单重态就行了。

谢谢指正,这个方法主要也是看到文献有人这么做。问题主要是过渡态单重态的多参考性质太强,而且多参考态方法也找不到过渡态,不知道这是合理的吗

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发表于 Post on 2024-1-29 18:17:57 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 hebrewsnabla 于 2024-1-29 19:50 编辑
w179152696 发表于 2024-1-29 17:06
谢谢指正,这个方法主要也是看到文献有人这么做。问题主要是过渡态单重态的多参考性质太强,而且多参考态 ...

首先你这个高斯输出文件显示你用的是RM06-2X,所以对称破缺并没有生效(应该需要指定UM06-2X),如果你期望这是个对称破缺单重态的话,目前算的结果也没什么意义。

你算的T1诊断应该是0.041不是0.41?可以再算个casscf单点看看自然轨道占据数,不要只看T1诊断。

顺便,你用molpro算的是RHF-RCCSD(T),也是没有对称破缺的。(我并不是说T1诊断要用UCCSD(T)来做,只是说RCCSD(T)用来算这个体系能量的话不合适)

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发表于 Post on 2024-1-30 02:22:54 | 只看该作者 Only view this author
假设文献方法确实合理的话,文献方法理论上不要求三重态的结构是优化后的结构吧?在单重态过渡态结构下算三重态单点就行了。
本来就不是所有的单重态过渡态都有对应的三重态过渡态。举例:Diels-Alder反应,如果变成三重态,4+2环加成就禁阻了,可能就改成2+2反应,或者自由基机理分步加成了。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-31 10:23:39 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-1-29 18:17
首先你这个高斯输出文件显示你用的是RM06-2X,所以对称破缺并没有生效(应该需要指定UM06-2X),如果你期 ...

感谢指导,我试过用非限制方法(um062x),发现在单重态下也找不到过渡态。。不知道这是啥原因~附件中为结果文件,其中好像也没有出现对称破缺。另外我在三重态rhf-uccsd(t)下也进行过单点能计算,发现T1诊断也在0.041左右

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-31 10:25:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-30 02:22
假设文献方法确实合理的话,文献方法理论上不要求三重态的结构是优化后的结构吧?在单重态过渡态结构下算三 ...

明白了,谢谢您的指导,不过我试过单重态下的单点能,T1诊断和单重态下没有太大变化。。都是0.041左右,说明能量计算可能不太准确。这个反应让我挠头了。。实在不行就只能先不报到了。。它在反应体系中也不是特别重要

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发表于 Post on 2024-1-31 10:30:04 | 只看该作者 Only view this author
w179152696 发表于 2024-1-31 10:23
感谢指导,我试过用非限制方法(um062x),发现在单重态下也找不到过渡态。。不知道这是啥原因~附件中为结 ...

我没看到有UM06-2X的输出文件。有检验过波函数稳定性吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-1 08:58:32 | 只看该作者 Only view this author
hebrewsnabla 发表于 2024-1-31 10:30
我没看到有UM06-2X的输出文件。有检验过波函数稳定性吗?

谢谢,已经解决了 确实是波函数没有稳定,我在stable=opt后在单重态优化出了和原先结构相差很大的过渡态,多参考性质没有这么明显了~

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