“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: sobereva
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Multiwfn资源与经验] 使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用

[复制链接 Copy URL]

2

帖子

0

威望

27

eV
积分
29

Level 2 能力者

16#
发表于 Post on 2026-1-23 23:39:39 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,在作图的时候出现了如图的黑色部分,想问问是什么原因导致的?此外在VMD中save的.vmd再打开后isosurface与save前的Translucent不一样了,想请问一下一般这样会怎么处理?

202601232333402568..png (747.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

202601232333402568..png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126137

管理员

公社社长

17#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-24 13:30:42 | 只看该作者 Only view this author
s1lence- 发表于 2026-1-23 23:39
老师您好,在作图的时候出现了如图的黑色部分,想问问是什么原因导致的?此外在VMD中save的.vmd再打开后iso ...

如果tachyon渲染后也这样,改用VMD 64bit版本再试

自己手动改
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

2

帖子

0

威望

27

eV
积分
29

Level 2 能力者

18#
发表于 Post on 2026-1-27 19:25:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-24 13:30
如果tachyon渲染后也这样,改用VMD 64bit版本再试

自己手动改

感谢老师解答,不过原本的图用的是VMD2 64bit的界面 在回调到1.9.3用tachyon渲染后黑影依然存在。另外界面里面Materials已经调到了一样的参数,然而预览界面依然异常,想请老师再看看是不是我的操作哪里不对

202601271923266789..png (30.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202601271923266789..png

202601271923042259..jpg (1.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 11)

202601271923042259..jpg

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126137

管理员

公社社长

19#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-28 02:54:23 | 只看该作者 Only view this author
s1lence- 发表于 2026-1-27 19:25
感谢老师解答,不过原本的图用的是VMD2 64bit的界面 在回调到1.9.3用tachyon渲染后黑影依然存在。另外界 ...

没让你用VMD2非正式版,根本甭考虑这个
老老实实用VMD 1.9.3 64bit版,论坛里就有
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

88

帖子

0

威望

2021

eV
积分
2109

Level 5 (御坂)

20#
发表于 Post on 4 day ago | 只看该作者 Only view this author
求助各位老师,用Multiwfn做一个晶体的HS分析,按步骤出来的图只有白色如图。不知道问题出在哪里?

202604091742474357..png (440.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202604091742474357..png

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126137

管理员

公社社长

21#
 楼主 Author| 发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
guoy14iccas 发表于 2026-4-9 17:44
求助各位老师,用Multiwfn做一个晶体的HS分析,按步骤出来的图只有白色如图。不知道问题出在哪里?

把GLSL打开
如果还是这个情况,说明Multiwfn做Hirshfeld surface分析过程操作有问题。先把帖子里的例子完整重复一遍
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-13 10:56 , Processed in 0.264924 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list