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[波函数分析求助] 如何利用VMD正确观看激发态之间的密度差

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本帖最后由 Ding-Ding 于 2024-2-23 13:17 编辑

各位老师好,最近在参考《使用Multiwfn计算激发态之间的密度差(http://sobereva.com/429)》这篇博文时,我可以按照步骤在Multiwfn里面绘制激发态之间的密度差图。

但是我想通过Multiwfn生成cube文件时发现只能生成一个密度增加的.cub文件,密度减少的cube文件无法生成。

想问一下大家,如何能正确同时生成两个文件,之后才可以用在VMD软件中。

1.png (82.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

VMD(左)与Multiwfn(右)对比

VMD(左)与Multiwfn(右)对比

2.png (123.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 22)

Multiwfn中生成cube文件的操作

Multiwfn中生成cube文件的操作

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发表于 Post on 2024-2-23 18:41:54 | 只看该作者 Only view this author
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用下文的脚本最省事,正负值部分直接同时显示出来
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-23 19:41:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-23 18:41
创建一个专门显示负值等值面的rep

用下文的脚本最省事,正负值部分直接同时显示出来

谢谢sob老师,刚刚解决了

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发表于 Post on 2024-10-24 20:01:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-23 18:41
创建一个专门显示负值等值面的rep

用下文的脚本最省事,正负值部分直接同时显示出来

Sob老师您好!我在阅读《在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》(http://sobereva.com/483)后,完成了VMD所在目录菜单中各类脚本的设置,但是在VMD中输入“cub XX”时,VMD显示“cub”为无效的指令!重新尝试多次以后依旧存在该问题,还希望Sob老师指导!

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发表于 Post on 2024-10-24 22:35:10 | 只看该作者 Only view this author
cySean 发表于 2024-10-24 20:01
Sob老师您好!我在阅读《在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法》(http://sobereva.com/ ...

脚本文件没放对位置,或者改完vmd.rc没重启VMD,或者vmd.rc没改对
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发表于 Post on 2024-10-25 09:03:46 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-24 22:35
脚本文件没放对位置,或者改完vmd.rc没重启VMD,或者vmd.rc没改对

非常感谢Sob老师!现在已经解决了!

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