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[Gaussian/gview] sobEDA输入文件中使用赝势计算时报错

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本帖最后由 CLJJ 于 2024-2-29 10:36 编辑

各位老师好,我最近在计算一个Am化合物的sobEDA,在输入文件中使用genecp关键词写入了ECP赝势,但是在计算时算几秒就会C掉,fragment1.out中的报错信息如下:
%chk=fragment1.chk
Route card not found.
Error termination via Lnk1e in /opt/apps/g16/l1.exe at Mon Feb 26 21:46:53 2024.

看起来好像是输入文件的问题(因为使用卢老师的算例就能正常计算,说明路径应该是对的)。
输入文件以及含有报错信息的输出文件已经上传,还请各位老师指教。
template.gjf (1.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 20) fragment1.out (4.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)


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发表于 Post on 2024-2-28 06:51:48 | 只看该作者 Only view this author
sobEDA所有输入文件一起上传,否则没法测试

C掉”语义不明


使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析
http://sobereva.com/685http://bbs.keinsci.com/thread-39446-1-1.html
上文提到的sobEDA教程文件包里(CO)5CrCH2是带赝势的例子,照着对比搞清楚原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 10:35:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 CLJJ 于 2024-2-28 10:45 编辑
sobereva 发表于 2024-2-28 06:51
sobEDA所有输入文件一起上传,否则没法测试

“C掉”语义不明

老师您好,我已经对比了您给出的算例,但是还是找不到原因,所有的输入文件已经重新上传,还请您帮忙看一下。

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发表于 Post on 2024-2-28 13:32:36 | 只看该作者 Only view this author
你的Multiwfn好像没有成功调用,你直接把pbs前面那段包括环境变量设置的部分复制到sobEDA.sh脚本前面,直接提交这个sh脚本应该就没问题了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 17:03:45 | 只看该作者 Only view this author
imasen 发表于 2024-2-28 13:32
你的Multiwfn好像没有成功调用,你直接把pbs前面那段包括环境变量设置的部分复制到sobEDA.sh脚本前面,直接 ...

谢谢同学的回复我已经解决了软件调用的问题,但是还是会报相同的错误,应该还是输入文件有问题。

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发表于 Post on 2024-2-28 17:59:43 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 imasen 于 2024-2-29 10:32 编辑
CLJJ 发表于 2024-2-28 17:03
谢谢同学的回复我已经解决了软件调用的问题,但是还是会报相同的错误,应该还是输入文件有问题 ...

因为你现在fragment.gjf没有正确生成,所以调用Multiwfn这一步肯定有问题,你可以把/dev/null改成read.txt,看一下输出里Multiwfn有没有正常运行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-28 19:53:36 | 只看该作者 Only view this author
imasen 发表于 2024-2-28 17:59
因为你现在fragment.gjf没有正确生成,所以调用Multiwfn这一步肯定有问题,你可以把/def/null改成read.tx ...

同学我已经按你所说的修改,但是还是报错,报错信息显示: Error: Unable to find the input file you specified in argument。

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发表于 Post on 2024-2-28 23:21:02 | 只看该作者 Only view this author
CLJJ 发表于 2024-2-28 19:53
同学我已经按你所说的修改,但是还是报错,报错信息显示: Error: Unable to find the input file you ...

你的system拼成sysytem了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-29 10:25:05 | 只看该作者 Only view this author
imasen 发表于 2024-2-28 23:21
你的system拼成sysytem了

谢谢同学的回复!之前只检查了文件中的内容,但是没有检查文件的名字下次不会了

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