晶体表面ESP分析cube文件的获取问题

ddddnight · 发表于 Post on 2024-3-3 18:41:40

本帖最后由 ddddnight 于 2024-3-4 09:41 编辑

老师，在做晶体表面ESP分析的时候，用cp2k生成的DENSITY.cube做图，另外一种是基于生成的molden文件，使用Multiwfn手册4.A.13中的方法，利用ESPiso.sh脚本生成cube文件（但是好像不支持周期性结构）。这两种方法分析做的图是一样的吗？

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-4 07:27:35

描述时不能有任何含糊性，自觉说清楚什么的手册。不要假定别人都知道你说的是Multiwfn手册
Multiwfn目前不支持对周期性体系计算静电势，没法直接用下文的脚本
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示）
http://sobereva.com/443（http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html）

必须自己用CP2K产生电子密度和静电势的cube文件，参考上文方式在VMD里直接绘制成填色等值面图。北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）里我讲电子结构分析的部分给了具体例子和脚本，画出来类似下图的效果

ddddnight · 发表于 Post on 2024-3-4 09:41:47

sobereva 发表于 2024-3-4 07:27
描述时不能有任何含糊性，自觉说清楚什么的手册。不要假定别人都知道你说的是Multiwfn手册
Multiwfn目前不 ...

好的，老师，已经修改成Multiwfn手册，谢谢您的提醒和解答

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[波函数分析求助] 晶体表面ESP分析cube文件的获取问题