自己构建的蛋白导入vmd后选中某条链，但不显示该链名称

jiaxing6821 · 发表于 Post on 2024-3-8 15:12:05

各位老师，我在pdb数据库下载了一个蛋白结构后根据需要构建了个新结构（原为两个对接的三聚体，我构建了个五聚体，如图所示），但是当我导入vmd时，选中某条链，但是不显示该链的名称，而我在修改pdb文本文件时，里面是写了各条链的名称的，请问这是什么原因呢？我导入pymol作图时，五聚体用cartoon结构却只显示了一条链，请问这又是什么原因呢？感谢您的解答！

sobereva · 发表于 Post on 2024-3-9 06:11:19

没有pdb文件，谁也没法准确回答
大概率格式没弄对

jiaxing6821 · 发表于 Post on 2024-3-9 10:03:50

Sob老师，我是从PDB库下载的pdb文件然后将原子信息部分复制出来制作的pdb文件，蛋白链的部分（如A，B，C）我都是在原pdb文件的位置并按顺序写的，请问是哪里的问题啊？感谢解答！

jiaxing6821 · 发表于 Post on 2024-3-21 15:28:43

sobereva 发表于 2024-3-9 06:11
没有pdb文件，谁也没法准确回答
大概率格式没弄对

我自己解决这个问题了，sob老师

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[VMD] 自己构建的蛋白导入vmd后选中某条链，但不显示该链名称

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