GaussView5.0.8生成阳离子pdb文件失败

whtu · 发表于 Post on 2016-11-1 09:51:12

我想用GaussView生成离子液体的中的BMIm（1-butyl-3-methyl-imidazolium）阳离子的pdb文件，然后想在Amber中跑一下，在用molclus进行构象搜索，可是生成pdb文件失败，错误信息如图所示，请问一下该如何解决？
谢谢。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2016-11-1 10:27:49

后缀改成pdb，不要是默认的gjf之类

1130240115 · 发表于 Post on 2016-11-1 10:31:45

命名处加入.pdb后缀，如1.pdb

1130240115 · 发表于 Post on 2016-11-1 10:33:17

pdb保存

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[Gaussian/gview] GaussView5.0.8生成阳离子pdb文件失败