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[新手求助] 求助:ORCA对铀酰配合物进行结构优化基组选择

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目前做的体系原子数在20-60个之间,除铀外还含有C、H、O、N,我目前对铀原子使用SDD赝势,基组选择SARC-ZORA-TZVP,其他原子使用def2-SVP基组。输入文件如下
! PBE0 D3 opt SARC/J noautostart miniprint nopop
%maxcore  2000
%pal nprocs  30 end
%cpcm smd true
  SMDsolvent "water"
end
%basis
  NewGTO U "SARC-ZORA-TZVP" end
  NewECP U "SDD" end
  NewGTO H "def2-SVP" end
  NewGTO N "def2-SVP" end
  NewGTO O "def2-SVP" end
  NewGTO C "def2-SVP" end
end
* xyz   2   1
原子坐标略
*
请问各位老师我这样做合理吗?


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发表于 Post on 2024-3-10 21:42:27 | 只看该作者 Only view this author
SARC系列基组是配合显式相对论方法(ZORA、DKH2)用的,不能搭配赝势使用。如果计算量允许,尽量用当前基组搭配ZORA。
SMD溶剂模型做结构优化,容易因为数值误差不收敛或有虚频(不过如果实际上收敛了且没有额外虚频,那么结果仍然是可以用的),一般建议用CPCM。
基组有更简单的写法,第一行写def2-SVP,然后删掉所有的NewGTO xxx "def2-SVP" end,和你现在写的效果是一样的。不过你现在的写法也是正确的。
其他应该问题不大
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-10 22:34:35 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-3-10 21:42
SARC系列基组是配合显式相对论方法(ZORA、DKH2)用的,不能搭配赝势使用。如果计算量允许,尽量用当前基组 ...

老师请问用当前基组搭配ZORA是指使用ZORA-def2-TZVP基组吗?我试了一下发现报错There are no main   basis functions on atom number  43 (U )。如果想使用赝势的话用什么基组比较好?还请老师指点

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发表于 Post on 2024-3-10 22:50:18 | 只看该作者 Only view this author
suyanxu 发表于 2024-3-10 15:34
老师请问用当前基组搭配ZORA是指使用ZORA-def2-TZVP基组吗?我试了一下发现报错There are no main   basi ...

不是,是用SARC-ZORA-TZVP,ZORA关键词是另写的。SARC-ZORA-TZVP、ZORA-def2-TZVP里的ZORA是基组名字的一部分,本身并没有指定用ZORA方法的作用,需要另写"ZORA"这个关键词,说明书里有很多示例。
铀比较重,赝势可能未必可靠,个人觉得还是用ZORA比较好
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-10 23:19:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-3-10 22:50
不是,是用SARC-ZORA-TZVP,ZORA关键词是另写的。SARC-ZORA-TZVP、ZORA-def2-TZVP里的ZORA是基组名字的一 ...

老师输入文件这样写对吗
! PBE0 D3 ZORA SARC/J opt CPCM(water) noautostart miniprint nopop
%maxcore  2000
%pal nprocs  30 end
%basis
  NewGTO U "SARC-ZORA-TZVP" end
  NewGTO H "def2-SVP" end
  NewGTO N "def2-SVP" end
  NewGTO O "def2-SVP" end
  NewGTO C "def2-SVP" end
end

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发表于 Post on 2024-3-10 23:31:31 | 只看该作者 Only view this author
suyanxu 发表于 2024-3-10 16:19
老师输入文件这样写对吗
! PBE0 D3 ZORA SARC/J opt CPCM(water) noautostart miniprint nopop
%maxcor ...

我觉得没问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-10 23:41:53 | 只看该作者 Only view this author

感谢老师抽出时间解答

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