IGMH怎么把.pdb文件对应的部分调为白色到蓝色的渐变？

Oliviaw · 发表于 Post on 2024-4-15 21:10:26

我只想改变pdb文件在VMD中显示的颜色。我试过graphics-representations-trajectory-color scale，调过很多数值都调不出白色到蓝色的渐变。我也试过graphics-colors-color scale里面的设置，这把相互作用的surface喝pdb文件对应的数据全部同时改色了。

还有别的办法吗？

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-16 03:27:19

“pdb文件” 指代不明。说清楚对什么设定颜色，等值面还是原子之类的
VMD同一时刻只能用一个色彩过渡设置，但不同rep可以用不同的色彩刻度范围。根据当前的色彩过渡方式和色彩刻度上下限自然能想明白怎么回事。

Oliviaw · 发表于 Post on 2024-4-16 11:18:23

本帖最后由 Oliviaw 于 2024-4-16 17:18 编辑

sobereva 发表于 2024-4-16 03:27
“pdb文件” 指代不明。说清楚对什么设定颜色，等值面还是原子之类的
VMD同一时刻只能用一个色彩过渡设置 ...

我是想对原子的occupacy采用不同于等值面的色彩范围。
我在representations里面设置原子的color scale，调不出白色到蓝色表示occupacy增强的颜色渐变模式。

representations-trajectory里面只有调颜色范围，没有调过渡方式的地方。

请问该怎么办？

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-17 04:21:06

Oliviaw 发表于 2024-4-16 11:18
我是想对原子的occupacy采用不同于等值面的色彩范围。
我在representations里面设置原子的color scale， ...

色彩过渡方式在Graphics - color - color scale里，对所有rep是统一的

搞清楚色彩刻度上下限和色彩过渡方式，自行理解

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