产生MOF-5力场优先用GAFF参数还是UFF参数？

slxc920113 · 发表于 Post on 2024-5-3 00:19:06

thor 发表于 2024-5-2 21:45
跑出来的结果看着不对，联苯这里弯折太厉害了

库伦作用导致的，如果你用量化计算UiO66的团簇结构，并且加了色散校正的话，也会出现这种情况，苯环因为色散校正的库伦发生扭曲。这个现象我不确定是合理的还是不合理。

thor · 发表于 Post on 2024-5-3 09:02:08

slxc920113 发表于 2024-5-3 00:19
库伦作用导致的，如果你用量化计算UiO66的团簇结构，并且加了色散校正的话，也会出现这种情况，苯环因为 ...

我感觉这是不合理的，IRMOF-10也有类似的BPDC结构，但是别人提供的输入文件模拟不会出现这种弯曲现象

thor · 发表于 Post on 2024-5-8 09:53:06

sobereva 发表于 2024-4-16 14:41
GAFF很普适也很好，GAFF能用的情况下，比起UFF这种只能用来凑合的力场往往强得多。虽然对于MOF还有其它专门 ...

社长，问一下，如果GAFF和UFF混用，比如优先GAFF，金属用UFF，1-4相互作用系数应该用GAFF的还是UFF的？

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-8 20:14:59

thor 发表于 2024-5-8 09:53
社长，问一下，如果GAFF和UFF混用，比如优先GAFF，金属用UFF，1-4相互作用系数应该用GAFF的还是UFF的？

UFF没明确定义1-4作用的scale系数，用GAFF的规则就完了。本来也没有专门的GAFF和UFF原子类型之间的参数，GAFF+UFF混用时UFF原子类型通常拿来描述刚性区域，1-4作用也不是什么敏感的问题

thor · 发表于 Post on 2024-8-25 17:56:10

sobereva 发表于 2024-5-8 20:14
UFF没明确定义1-4作用的scale系数，用GAFF的规则就完了。本来也没有专门的GAFF和UFF原子类型之间的参数， ...

社长问一下有没有GAFF+UFF模拟MOF的文献呢？好像很少这样做

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